前言 首先，对3个R包进行简单介绍。methylkit：用于高通量亚硫酸氢盐测序的DNA甲基化分析和注释的R包。该...[作者空间]
日常掰虾 前面学习了DNA甲基化的基础知识，也了解了它的重要性，不知道的同学看这里，DNA甲基化知识概述[ht...[作者空间]
概述 参数解释 单端测序：0代表单端测序，16代表这个序列比对到参考序列的负链上。MethylExtractBSC...[作者空间]
今天做展示PPT的时候发现可以用一种更简单的方式计算之前计算过的内容，因此更新一下之前的结果。1.相关性分析结果 ...[作者空间]
特异性分析 得到1495个组织特异性的启动子甲基化区域。（由12118个启动子甲基化区域得到）不重复的基因只有13...[作者空间]
GTEX表达矩阵预处理 R语言学习：1.append添加新的列。2.R语言处理大规模数据速度不算快，通过安装其他包...[作者空间]
接复盘总结（一） methylkit R包上游处理 对甲基化位点进行注释、导出SPM分析上游文件 几点说明：1.启...[作者空间]
新年最适合干什么？当然是复盘总结！！先从代码开始复盘。 linux处理bed文件 用linux不多，还是一开始尝试...[作者空间]
methylKit是一个用于分析DNA甲基化测序数据的R包，其核心功能是差异甲基化分析和差异甲基化位点/区域的注释...[作者空间]
在《WGBS 全基因组甲基化测序》)讲解了 WGBS 测序原理，简而言之是 BS 处理将未甲基化 C 转化为 U(...[作者空间]
测序数据质控fastp genome preparation alignment bismark_deduplic...[作者空间]
