R包-ggtreeExtra绘制进化树 ggplot2提供的geom_tile图层可以画热图了,ggplot2的g...[作者空间]
前面介绍了WGDI,今天分享另一个工具MCscanX。 MCScanX是另外一个检测基因共线性和进化分析的常用工具...[作者空间]
使用TBtools做物种间共线性分析的时候,使用A物种基因和拟南芥的基因做共线性分析,得到的collinearit...[作者空间]
本文参考 生信札记[https://www.jianshu.com/u/068665394ccf] 相关内容制作 ...[作者空间]
CONCEPTS In genetics, dN/dS also known asor Ka/Ks, is use...[作者空间]
明晰概念 基因是染色体上一段可以发生转录的区域 基因≠CDS 基因应该包括:CDS 内含子 UTR 启动子 可转录...[作者空间]
主要是参考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 ...[作者空间]
首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具,为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白,在做多物种间共...[作者空间]
你需要知道:基因组( Genome):指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。基...[作者空间]
一:数据准备 自己去下载拟南芥的基因组,gff3,CDS序列,pep文件。 1.根据gff文件获得基因位置信息。 ...[作者空间]
写在前面 热图,或称热力图,是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据...[作者空间]
Data preparation 继续上次的内容,下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下,下载好的数据。 ...[作者空间]
blast数据库说明地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/documents/b...[作者空间]