日常瞎掰 HiC-seq可以用来研究基因组范围内的染色体片段之间的交互情况,这其中会涉及到染色质区室(A/B ...[作者空间]
该R包由国外友人Enblacar完成,目前处于预印本阶段,旨在提供一种简化的方式,为已知的单细胞可视化生成可发布的...[作者空间]
我的需求:基因表达差异分析结果的表格,每行是一个基因,不同的列分别表示表达值、Fold Change、P valu...[作者空间]
1. 相关性检验 得出相关系数我们并不一定能得出数据之间的相关水平,这时候我们会进行相关性检验来进行量化。置信区间...[作者空间]
本文分享我的 ATAC-Seq 分析流程,为了控制篇幅,关键的 Peak calling 步骤会详细介绍,而 Mo...[作者空间]
Homer这个软件比较强大,主要做ChIP-Seq分析,除此之外,还可以做RNAseq以及microarray的分...[作者空间]
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATA...[作者空间]
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的...[作者空间]