Week24 — 人类原发性肿瘤的染色质可及性图谱-01上篇文章首先回顾了ATAC-seq方法的原理和优点，以及与...[作者空间]
第24周 2018 — 10.28-11.3 原文链接：The chromatin accessibility l...[作者空间]
安装 MACS2功能：macs2 callpeak 是macs2最主要的一个功能，能够利用bam文件寻找chip ...[作者空间]
给学徒的ATAC-seq数据实战 本次给学徒讲解的文章是 :The landscape of accessible...[作者空间]
Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接：harvardin...[作者空间]
还记得生信技能树的传送门系列吗？转录组、甲基化、ChIP-Seq、lncRNA、编程实战、还有已经在更新中的Hi-...[作者空间]
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异...[作者空间]
上一篇介绍了使用ChIPseeker对peaks的分布和邻近基因的注释。除此之外，下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣...[作者空间]
上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后...[作者空间]
学习目标： 探讨ChIP-seq数据质量低的来源 理解链交叉相关性（ strand cross-correlati...[作者空间]
学习目标： 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Call...[作者空间]
这部分内容包括对原始测序数据质控，然后比对过滤，这是所有NGS数据处理的上游分析。 ATAC-Seq与其他方法不同...[作者空间]
ATAC-Seq简介 ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chro...[作者空间]
前言 ATAC-seq/ChIP-Seq中重复样本的处理ATAC-Seq要求必须有2次或更多次生物学重复（十分珍贵...[作者空间]
1. 学习目标 讨论ChIP-seq数据质量评估的其他方法 用ChIPQC产生质量统计报告 鉴定低质量数据的来源概...[作者空间]
文档链接：https://github.com/taoliu/MACS/MACS2是ChIP-Seq、ATAC-S...[作者空间]
第四周 2018— 06.11-06.17原文： chromVAR: Inferring transcriptio...[作者空间]
callpeak用法 这是MACS2的主要功能，因为MACS2的目的就是找peak，其他功能都是可有可无，唯独ca...[作者空间]
背景： 染色质和染色体的结构和功能 每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装，...[作者空间]
