DESeq2文库标准化 问题1：调整文库大小的差异 样本1的read是样本2的一半,样本2中每个基因的read是样...[作者空间]
热图 这是热图，行是gene，列是RNA-seq样本。这个数据已经通过两种方式进行了修饰，因此我们可以从中获得一些...[作者空间]
层次聚类 层次聚类(Hierarchical Clustering)通常与热图有关(heatmap)。热图的列代表...[作者空间]
t-SNE 这是一个基本的二维散点图，我们来看看t-SNE是如何变换这个图的，在数轴上画出平面的一维图。 注意:如...[作者空间]
MDS and PCoA 多维缩放(Multi-Dimensional Scaling)分为： 经典的(class...[作者空间]
R实现主成分分析 如何使用prcomp()函数来做PCA 如何使用基础图形和ggplot2绘制PCA图 如何确定每...[作者空间]
ChIP-Seq简介 注意:此StatQuest是基于对RNA-seq的介绍，所以请先观看，除非您已经完全了解RN...[作者空间]
RNA-Seq简介 举个例子，现在我们有一群正常的神经细胞，一群突变的神经细胞，突变细胞的行为与正常细胞不同。我们...[作者空间]
期望值 你们知道，概率(probability)和期望值(Expected Values)是统计学的两个基本组成部...[作者空间]
什么是比率比和比率比对数 当人们说比率比(odds ratio),他们是在谈论比率(odds)的比(ratio)。...[作者空间]
你很有可能已经对比率(odds)很熟悉了，例如，你可以说我们队获胜的比率是1：4。事实上，我们有5个游戏，1个游戏...[作者空间]
下图是正态分布(normal distribution)的方程,有两个参数。第一个参数是希腊字母μ，它决定了正态分...[作者空间]
现在，如果我们想计算p = 0.5的似然，那么我们需要做的就是重新排列方程的左边。现在方程的左边写着:“p(选橙色...[作者空间]
为了理解为什么除以n会低估总体方差(population mean)，我们会从几个简单的例子开始，然后用数学证明，...[作者空间]
指数分布(exponential distribution):这是一种统计分布，用来模拟事件之间的时间。你要等多久...[作者空间]
我们先来看看关于正态分布的概率(Probability)(记住，这个概念适用于所有连续分布)。在这种情况下，我们假...[作者空间]
假设我们有一些来自微阵列实验的数据 如果你不熟悉微阵列，这里有独家新闻: 微阵列测量样本中基因的活性。 他们通过测...[作者空间]
我们共检测了15个基因的表达。这个数据是正态分布的吗?Q-Q图有助于回答这个问题。 给每个点一个分位数 得到一条正...[作者空间]
