美文网首页
2021-03-29 QC针对不同群体的过滤

2021-03-29 QC针对不同群体的过滤

作者: L6511 | 来源:发表于2021-03-29 20:26 被阅读0次

    重组自交系(Recombinant Inbred Lines)是生物学中用于遗传分析及作图的一类群体,由F2群体的个体多代自交产生,群体中每个株系都是纯合的。也就是说,杂交后的材料F2代经过一代代连续自交获得的自交系就是重组自交系。每个株系都是纯合的。

    所以我认为符合这句话


    image.png

    师兄也是这样肯定的,


    image.png
    image.png

    全基因组测序,测的是全部序列,可以发现别人没有、您个人独有的基因序列变化。而芯片只能检测已知的变化,而且只能是有限的基因序列。尽客SNP芯片法检测成本低,便获得的信息的完整性同全基因组测序相比差很远。

    所以maf可以宽松一点到0.03/0.02,其他条件可以再设置一下,保证严格的过滤


    image.png

    相关文章

      网友评论

          本文标题:2021-03-29 QC针对不同群体的过滤

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/cdgvhltx.html