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seqkit的安装(计算GC)

seqkit的安装(计算GC)

作者: 路人里的路人 | 来源:发表于2022-10-15 10:44 被阅读0次

    第一步 安装seqkit

    conda install -c bioconda seqkit
    

    第二步 计算GC含量

    seqkit fx2tab -l -g -n -i -H test.fasta
    #test.fasta是要计算的文件
    

    第三步 结果解读

    #id          length     GC
    test.fasta  170166  35.43
    #结果显示了物种名称,序列长度,GC含量
    

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