第一步 安装seqkit
conda install -c bioconda seqkit
第二步 计算GC含量
seqkit fx2tab -l -g -n -i -H test.fasta
#test.fasta是要计算的文件
第三步 结果解读
#id length GC
test.fasta 170166 35.43
#结果显示了物种名称,序列长度,GC含量
conda install -c bioconda seqkit
seqkit fx2tab -l -g -n -i -H test.fasta
#test.fasta是要计算的文件
#id length GC
test.fasta 170166 35.43
#结果显示了物种名称,序列长度,GC含量
本文标题:seqkit的安装(计算GC)
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