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433. 最小基因变化
问题描述
基因序列可以表示为一条由 8
个字符组成的字符串,其中每个字符都是 A
、C
、G
和 T
之一。
假设我们需要调查从基因序列 start
变为 end
所发生的基因变化。一次基因变化就意味着这个基因序列中的一个字符发生了变化。
例如,AACCGGTT
--> AACCGGTA
就是一次基因变化。
另有一个基因库 bank
记录了所有有效的基因变化,只有基因库中的基因才是有效的基因序列。(变化后的基因必须位于基因库 bank
中)
给你两个基因序列 start
和 end
,以及一个基因库 bank
,请你找出并返回能够使 start
变化为 end
所需的最少变化次数。如果无法完成此基因变化,返回 -1
。
注意:起始基因序列 start
默认是有效的,但是它并不一定会出现在基因库中。
示例
输入:start = "AACCGGTT", end = "AACCGGTA", bank = ["AACCGGTA"]
输出:1
输入:start = "AACCGGTT", end = "AAACGGTA", bank = ["AACCGGTA","AACCGCTA","AAACGGTA"]
输出:2
输入:start = "AAAAACCC", end = "AACCCCCC", bank = ["AAAACCCC","AAACCCCC","AACCCCCC"]
输出:3
解题思路
可以用广度优先搜索的思路进行解题,尝试所有可能的基因变化,直到找到最少的变化次数。
代码示例(JAVA)
class Solution {
public static int minMutation(String start, String end, String[] bank) {
Set<String> bankSet = new HashSet<>();
Set<String> visited = new HashSet<>();
for (String str : bank) {
bankSet.add(str);
}
// 如果end不在bank中,无法完成
if (!bankSet.contains(end)) {
return -1;
}
// 如果 start = end,返回0
if (start.equals(end)) {
return 0;
}
char[] chars = {'A', 'C', 'G', 'T'};
int count = 0;
Queue<String> queue = new LinkedList<>();
queue.offer(start);
while (!queue.isEmpty()) {
count++;
int curSize = queue.size();
for (int i = 1; i <= curSize; i++) {
String str = queue.poll();
for (int j = 0; j < 8; j++) {
for (int z = 0; z <= 3; z++) {
if (str.charAt(j) != chars[z]) {
StringBuilder newStr = new StringBuilder(str);
newStr.setCharAt(j, chars[z]);
if (!visited.contains(newStr.toString()) && bankSet.contains(newStr.toString())) {
// 和end匹配上了
if (end.equals(newStr.toString())) {
return count;
}
queue.offer(newStr.toString());
visited.add(newStr.toString());
}
}
}
}
}
}
return -1;
}
}
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