一. ATAC-seq
1. 冻存细胞样本
（1）取出培养的悬浮细胞，显微镜下观察细胞生长状态是否良好，是否有细菌污染，然后用PBS洗涤并离心弃上清，细胞沉淀进行冻存操作（贴壁细胞需要消化为悬浮细胞）；
（2）用冻存液重悬细胞沉淀，移至冻存管（提前配置细胞冻存液，要避免新配置的冻存液过热而损伤细胞）；
（3）冻存细胞解冻后，常规需要有5万个状态良好的细胞开展实验，因此建议将50万个细胞用于上述冻存操作；
（4）随后，将冻存管置于程序降温冻存盒，放在-80度进行梯度降温并暂时保存（严格按照程序降温操作，对细胞造成的损伤降到最低）；
（5）24 h后，将程序降温盒中的细胞样本转移至液氮中保存。
2. 动物组织样本
（1）取下新鲜组织，立即剔除结缔组织和脂肪等杂质；
（2）将组织样本转移至新的离心管中，用预冷的PBS漂洗，直至将组织表面的残留血液冲洗干净；
（3）用无尘纸擦干水分，如果组织体积较大，应在冰上将组织切成小块，约50 mg/份，之后置于冻存管内；
（4）将冻存管迅速置于液氮中冷冻30 mins，然后转移至-80度中保存（要注意冻存管密封性和质量）。
3. 植物组织样本
（1）从植株取下新鲜幼嫩组织，取材后用清水将材料表面的灰尘或泥土冲洗干净，吸干表面水分；
（2）如果组织体积较大，应在冰上将组织切成小块或薄片，然后放入合适体积的冻存管或锡箔纸中，每份>200 mg；
（3）将冻存管或锡箔纸置于液氮中冷冻30 mins，之后保存于-80度。
二. Hi-C
1. 细胞样本
（1）确定细胞无污染，常规每个文库建议培养1x10^6用于甲醛固定（低细胞量可评估）；（2）新鲜细胞计数后重悬于完全培养基中，加入甲醛（终浓度2%)，室温固定10 mins；
（3）加入适量甘氨酸溶液，保证甲醛和甘氨酸充分混匀，培养基会由粉红色变为亮黄色，室温终止固定10 mins；
（4）离心弃上清，然后用PBS洗涤，再置于-80度保存。
2. 动物组织样本
（1）组织离体后，用预冷的PBS将组织表面残留洗净；
（2）用无尘纸擦干水分，在冰上将组织切成小块，约200 mg/份（肝脏、肾脏、脑、肌肉），之后置于冻存管内（低组织量可评估）；
（3）将冻存管放入液氮中冷冻30 mins，然后转至-80度保存。
3. 植物组织样本
（1）将幼嫩组织小心清洗干净，避免损伤；
（2）常规每个文库建议准备1 g幼嫩组织（低组织量可评估）；
（3）用锡箔纸包裹组织，置于液氮中冷冻30 mins，然后转至-80度保存。
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