HiC-Pro的安装

要使用 HiC 数据就会不可避免的要使用到 HiC-Pro，但是 HiC-Pro 是一个比较难缠的软件，需要安装的东西比较多，会影响的东西比较多，因此我们使用conda建立一个新环境来安装HiC-Pro。

1. 首先，下载HiC-Pro软件。

wget -c https://github.com/nservant/HiC-Pro/archive/refs/tags/v3.1.0.tar.gz
tar -zxvf v3.1.0.tar.gz
cd HiC-Pro-3.1.0

2. 然后，构建运行环境，建议采用以下代码在conda环境中安装。conda env create -f environment.yml 含义

conda env create -f environment.yml -p hicpro

3. 配置一下 config-install.txt file
   注意这些都是目录，不是执行程序的路径，如下：

CLUSTER_SYS是作业调度系统，仅支持TORQUE, SGE or SLURM系统。

4.最后，再执行以下命令安装

# 配置一下 Edit config-install.txt file if necessary
make configure
make install

参考：https://blog.sciencenet.cn/blog-2970729-1371699.html