library(ggplot2)
data <- read.table("C:\\Users\\86150\\Desktop\\fragments\\RD20220208-LPC-12462FND.fragment.length.txt",header=F)
length_cutoff <- 1200
fragment <- data$V1[data$V1 <= length_cutoff]
breaks_sum <- 500
res <- hist(fragment,breaks = breaks_sum,plot = FALSE)
plot(x=c(0,res$breaks),y=c(0,0,res$counts)/10^3,type="l",col="red",xlab = "Fragment length(bp)",ylab = expression(Normalized ~ read ~ density ~ 10^3),main="Sample Fragment sizes")
结果图
image.png
结果图
参考： 给你bam文件，你会画插入片段长度分布图吗？ 糗世界-ATAC-seq 「文献02」esATAC: 一个A...
对于ATAC文库而言，其插入片段的长度分布有着非常典型的规律，示意如下 每200bp会存在一个峰，这个周期性波动反...
1选择Gibson组装 2选择线性化方式 3选择插入片段 右侧Source of Fragment选择插入片段，...
bowtie2 比对 其中bowtie2比对加入了-X 2000 参数，是最大插入片段，宽泛的插入片段范围(10-...
发现在简书中插入代码有以下几种方式 使用`code here` 使用```code block here``` 按...
使用innerHTML插入含 的文本，这些 会被加入DOM中，但不会执行。 （1）插入script片段 结果：sc...
使用头尾插入`单行代码，适用于解释代码时使用。 ifconfig 使用头尾插入```代码片段，适用于大段代码。
Jobs数量地区分布图 点赞最多的 Topic 给薄荷网赞一个! 下面是主要程序片段 Top 20 附加：PM2....
琢磨了一晚上，带着些许不安，终于小心翼翼做下了决定。其实想想还是挺感恩的，有两份感觉都非常棒的机会让我去选择。 面...
本文标题：01.插入片段分布图
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/ggdtrrtx.html
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