Paper_1：癌症细胞系百科全书之定量蛋白组

癌症细胞系百科全书之定量蛋白组

Highlights

1. 对来自CCLE计划的不同谱系的375个细胞系进行了蛋白组定量
2. 探讨了不同通路之间蛋白质表达的相关性
3. 在微卫星不稳定的细胞中存在多种蛋白复合物的下调
4. 蛋白复合物和基因敲除、突变的灵敏性存在一些关联

Summary

蛋白质是进行生命活动的重要分子。目前来看，包含CCLE在内的细胞系整合计划主要工作集中在基因层面的描述，然而，蛋白组的深度解析还未展开。在这篇文章中，我们采用质谱对来自不同谱系的375个细胞系进行了蛋白质的定量描述，得到了此前DNA, RNA层面没有提供的信息，进而丰富了CCLE的内容。我们意外地发现一些通路之间存在相关性，大部分是从RNA层面检测不到的。微卫星不稳定细胞系的分析揭示了与突变和翻译维持相关的蛋白复合物的失调。这些蛋白复合物和几个基因敲除的灵敏性有关。这些数据和发现使CCLE更加完善，CCLE作为研究资源也将有助于细胞行为和癌症等相关研究。