DBTSS;转录起始位点数据库。
为了支持转录调控研究,我们构建了 DBTSS,它基于我们独特的经过实验验证的 TSS 测序方法 TSS-seq,代表了基因组中转录起始位点 (TSS) 的确切位置。该数据库包括人类成人和胚胎组织的主要部分的 DBTSS 数据。 DBTSS 现在包含 4.91 亿个 TSS 标签序列,从总共 20 个组织和 7 个细胞培养物中收集。我们还整合了我们新生成的亚细胞分级 RNA 的 RNA-seq 数据和组蛋白修饰的 ChIP-seq 数据、RNA 聚合酶 II 和培养细胞系中的几种转录调节因子。我们还包括最近积累的外部表观基因组数据,例如 ENCODE 项目的染色质图。
总之,我们提供了一个独特的数据资源来研究在各种样本的特定基因组坐标中观察到哪些基因组特征。我们相信新的 DBTSS 有助于了解大量识别的 TSS 的生物学后果,并确定与无序转录调控相关的人类基因估值。
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