在构建进化树的时候，许多基因名称都特别的长，做出来的进化树特别丑，像这一种
图片.png
这篇文章分享一个脚本，可以批量更改每个基因的名称~
#!/usr/bin/env python
import sys,re
in1=open(sys.argv[1],'r')
out=open(sys.argv[2],'w')
num=0
for eachline in in1:
m=re.match(">",eachline)
if m:
num+=1
out.write(">AP%s\n"%(str(num)))#将>后的字符更改为AP+数字
else:
out.write(eachline)
in1.close()
out.close()
结果如下
图片.png
大家有更好的方法，欢迎分享~
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本文标题：2022-05-20分享代码-批量更改fa文件序列名称的pyth
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/jwxfprtx.html
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