箱线图加注释的方法
compare_means()函数
该函数主要用用法如下:
compare_means(formula, data, method = "wilcox.test", paired = FALSE,
group.by = NULL, ref.group = NULL, ...)
注释:
formula:形如x~group,其中x是数值型变量,group是因子,可以是一个或者多个
data:数据集
method:比较的方法,默认为"wilcox.test", 其他可选方法为:"t.test"、"anova"、"kruskal.test"
paired:是否要进行paired test(TRUE or FALSE)
group_by: 比较时是否要进行分组
ref.group: 是否需要指定参考组
stat_compare_means()函数
主要用法:
stat_compare_means(mapping = NULL, comparisons = NULL hide.ns = FALSE,
label = NULL, label.x = NULL, label.y = NULL, ...)
注释:
mapping:由aes()创建的一套美学映射
comparisons:指定需要进行比较以及添加p-value、显著性标记的组
hide.ns:是否要显示显著性标记ns
label:显著性标记的类型,可选项为:p.signif(显著性标记)、p.format(显示p-value)
label.x、label.y:显著性标签调整
...:其他参数
详细参考:BioMarkerInfo
ps: 参考链接是个特别棒的推文,很详细。
网友评论