FAPROTAX数据库
在微生物多样性分析中，FAPROTAX数据库是常用的群落功能注释数据库。FAPROTAX数据库是Louca等人根据已发表的文献手动构建的数据库，目前收集自4600多个原核微生物的80多个功能分组7600多条功能注释信息，并且现在仍在持续更新。FAPROTAX数据库在注释海洋湖泊生物化学过程（硫、氮、氢和碳循环）中的功能、土壤微生物的功能等等应用较多且效果不错。
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TUTU云工具使用
TUTUCLOUD网站提供在线实现FAPROTAX数据库功能注释的工具，并通过柱状图的形式展示其可视化成果。操作步骤如下：
①登录网址：https://www.cloudtutu.com/#/index（推荐使用360或者谷歌浏览器）；
②输入用户名和密码（已经填好了），输入验证码后即可登录，无需注册，直接使用；
③登录后在工具一栏（全部分析）里找到FAPROTAX，点击进入；
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作。
Step 1：上传数据
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理，但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据，以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据，如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表等等)；
b)表格需要带表头和列名，每一列为样本名，每一行为各种指标数据名，例如OTU、基因ID、代谢物名称等，最后一列必须添加taxonomy；
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为：全选excel中的所有内容（ctrl+A），复制到记事本中，将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。
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Step 2：调整参数
2.1 绘图类型：目前平台提供柱状图的绘图类型
2.2 自定义标题、横/纵坐标：按需自行设置
2.3 柱状图类型：fill、stack
2.4 绘图数量：绘制的元素数量
2.5 是否绘制others：others表示剩余元素的合并
2.6 柱宽度、横/纵坐标字体大小、图例大小、横坐标字体旋转及图片DPI（图片像素）等：按需自行设置
Step 3：下载文件
根据个人需求进行参数调整后点击运行，平台提供PDF文件以及表格下载。
Step 4：作图后处理
TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图，可通过矢量图处理软件进行编辑和调整（如：文字字体，文字大小，图片分辨率等）。
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