TCGAbiolinks数据下载miRNA失败
image.png
新建一个文件夹00_data_read_in_one_file用于存放所有的文件
image.png
image.png
设置工作目录到00_data_read_in_one_file文件夹内，查看文件数目
image.png
在使用gdcRNAtools 时会有一个这样的命令，就是
####### Filter duplicated samples in miRNAs metadata #######
metaMatrix_filter_dupli <- gdcFilterDuplicate(metaMatrix.MIR)
是因为下面的情况存在
zai
gdcRNAtools 下载metadata总是报错,和网络有很大关系
####### Parse RNAseq metadata #######
metaMatrix.RNA <- gdcParseMetadata(project.id = 'TCGA-BRCA',
data.type = 'RNAseq',
write.meta = FALSE)
image.png
网友评论