基因组组装练习

• 上Genome Announcements网站（https://mra.asm.org/）找一篇细菌基因组文章；找到文章记载的SRA号；
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• 从SRA数据库上用prefetch下载该文件

  
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• Fastq-dump解压；

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• Fastqc质控；去接头；

  
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中途却因Java显示内存不够，采取方法① 截取序列，但是失败了，采取方法②更换更小的序列，依旧失败，求助老师后，将java的内存更改

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运行成功

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• Spades组装基因组草图；

  
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• Quast评价组装的基因组效果

  
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