恰恰是实现梦想的可能性，才使生活变得有趣。
夜幕降临时，圣地亚哥赶着羊群来到一座废弃的老教堂前。教堂屋顶已经塌了，原来圣器室的位置是一棵无花果树。
他决定在这里过夜。他又想起了她，一个令他魂牵梦绕，让他忘记自由自在周游世界的快乐。想着四天后就要再见到她时，他即兴奋又忐忑。
然而他又做了那个同样的梦，于是他决定在途中先去找一个老妇人解梦。关于这场奇幻的冒险之旅自此开始。老妇人告诉他应该去埃及金字塔寻找宝藏，而自己解梦的报酬就是宝藏的十分之一。
然而就在男孩准备忘记这荒诞的梦的解析的时候，一位老人出现了。他是撒冷之王，他了解男孩的内心世界，知道男孩父母亲的名字，童年时期的玩耍和他爱的女孩的名字。于是男孩由原来的傲慢与冷漠变得钦敬而腼腆了。
他和撒冷之王聊了天命，聊了世界之魂。天命就是你一直期望去做的事情，人一旦步入青年时期，就知道什么是自己的天命了，在人生的这个阶段，一切都那么明朗，没有做不到的事情。人们敢于梦想，期待完成他们一生中喜欢做的一切事情。但是随着时光的流逝，一股神秘的力量开始企图证明，根本不可能实现天命。
男孩面对自由自在的风，羡慕之情油然而生。他意识到他也可以像风一样自由，什么也不能阻止他，除了他自己。羊群，商人的女儿，安达卢西亚的大地，只不过是他在达成天命的途中留下的足迹。
于是他卖掉了自己的羊群，只留下六只作为撒冷之王的酬谢。撒冷之王给了他两块宝石，乌凌和图明（炼金术士占卜用的宝石）。男孩买了船票，来到了另一块大陆。不过很不幸，在一个小酒馆，由于语言不通，他误解了点老板的好意，轻信了一位少年。很快他就被自己的新朋友骗的身无分文。
他哭了，埋怨上帝的不公，竟以这种方式回报相信梦想的人。他拿出那两块宝石，想要问他们今后该何去何从。然而他刚要拿起宝石，两块宝石就从褡裢的破洞漏了出去。男孩笑了，他知道这是一个预兆，并暗下决心，有些事情是不能问的，不能逃避自己的天命。
他辗转奔波后，最终在一家水晶店找到了工作。一个月后他说服老板做了一个陈列架放在门口。因为，并非所有的人都以一样的方式对待梦想。就像水晶店老板的梦想是去麦加朝圣，但他却从不行动，因为他要永远保留这个梦想，他怕实现以后的空虚和无力。六个月是，他又说服老板开始在店里卖茶，因为人们爬上斜坡往往会感到疲惫，而坡顶上有一家出售漂亮水晶制品的商店，备有清凉的薄荷茶。就这样一年的时间过去了，他攒够了足够的钱。可以重新买一个羊群，做回自己自由自在的牧羊人。
可正如水晶店老板说的那样，“你知道我不会去麦加，就像你知道自己不会回去买羊一样。”那一刻男孩感到无比快乐。他随时可以重新去当牧羊人，随时可以回水晶店。但是他曾经重复做过同一个梦，并遇见过一位王，这可不是什么人都能经历的事。男孩兴冲冲的踏上了去往寻宝的路途。
他跟一个商队同行，同行之人中有一个英国人，他是一名炼金术士。英国人一直埋头读书，男孩则习惯于观察沙漠。很快就有消息传来，说是部落之间正在打仗，这对商队的旅途非常不利。男孩开始读起了英国人那些炼金术的书籍，他知道了元精的存在。元精的液体部分叫做长生不老液，固体部分叫点金石。后来男孩把书还给了英国人。他明白“每个人都有自己的学习方式，他的方式不属于我，我的方式不属于他。但是我们都在追寻各自的天命，为此我尊重他。”
伴随着战火焚天的消息，他们终于到达了绿洲，暂时躲避了战争的侵扰。男孩开始帮助英国人寻找真正的炼金术大师。也就是在这个过程中，他遇到了一生中命中注定的天命。
时间仿佛在刹那间停止，世界之魂蓦然出现在圣地亚哥面前。当男孩看见少女那双黑色的眼睛，看见他似笑非笑的面容，似启非启的双唇，他明白了世上最重要和最智慧的表达方式，也就是人类都能理解的语言。这就是所谓的爱情。世上总有人在等待着另外一个人，无论是在大沙漠还是在大城市，当这两个人最终四目相对的时候，过去的一切和将来的一切全都变得无足轻重了，只有眼前的这一刻最重要。
那天地中海东风刮到他脸上的，正是那少女的芳香。他明白了早在知道她的存在之前他已经爱上了她，并且明白了，凭他对少女的爱就能找到世上所有的宝藏。
男孩每天都去水井旁等候那个女孩法蒂玛，他把自己的经历讲给她听，他们成了朋友。法蒂玛则告诉他“我希望你继续前行，去追寻你的梦想，如果必须等到战争结束，那就等。但是，如果你想提前启程，那就去追寻天命。沙丘会随风改变形状，但沙漠永远存在。我们的爱情也如此。”
他在冥想中出现了幻觉，他看到一支剑拔弩张的军队进入了绿洲，他觉察到现在的绿洲是险境，沙漠则为安全之地。他把自己幻象告诉了绿洲头领们，只有一位老人听信了他的话。他们遵从了这个预兆，并在第二天在充足的准备下消灭了前来侵袭的沙漠骑兵。圣地亚哥于是被奉为部落的顾问。
不过这也由此引出了炼金术士的到来，他考验了男孩的勇气，并让他在战斗结束后去找他。炼金术士为他描绘了继续在绿洲生活的轨迹，最终的结果是男孩将被预兆抛弃，无法完成自己的天命。而关于爱情，爱情从来不会阻止一个男人去追寻天命。如果会阻止，一定因为那不是真正的爱情，不是用宇宙语言表达的爱情。然后他们就继续踏上了寻找宝藏的路途。
路上，男孩问炼金术士他还能学到什么？炼金术士回答“要想学到本事只有一种方式，那就是行动。”炼金术师告诉他，要倾听自己的心声，因为如果你对自己的心非常了解，他就永远打击不到你。谁也不能逃避自己的心，所以最好倾听心在说什么。害怕遭受痛苦比遭受痛苦本身还要糟糕，没有一颗心在追求梦想的时候感到痛苦，因为追寻过程的每一刻，都与上帝和永恒同在。
不过，危险还是出现了。他们被士兵押送到了一处军营。炼金术士则告诉军官们圣地亚哥可以变成风，仅仅展示一下他的威力，而如果做不到，则愿意奉上两人的性命。军官们同意了。可圣地亚哥并不知道问么把自己变成风，他去问炼金术士。可他只是告诉他追寻天命的人，知道自己需要掌握的一切。只有一样东西令梦想无法成真，那就是担心失败。
于是圣地亚哥爬上兵营的一块巨石制高点。他一直凝视着沙漠，倾听自己的心声。他和沙漠对话，和风对话，和太阳对话，最终和创世神对话。西蒙风从来没像今天刮的这么凶猛。阿拉伯地区将会世世代代流传一个男孩的传说，说他把自己变成了风，几乎摧垮了一座军营，挑战了沙漠中最声名显赫的指挥官的权威。
而后，炼金术士就和男孩在一座修道院道别了，因为离金字塔只有三个小时的路程了。他用点石成金术练成了金子，然后把它分成了四块，一块给了招待他们的修士，感谢他的慷慨；一块自己留着；一块给了男孩用来偿还军官剥夺的银币；还有一块留给男孩将来所需，由修士暂为保管。因为男孩已经两次失去了旅途中的所有钱财，而他又坚信：所有发生过一次的事，可能永远不会再发生；但所有发生过两次的事，肯定还会发生第三次。
圣地亚哥终于到了藏宝之地。他在圈定的地方挖了整整一夜，结果一无所获。后来有几个人来到他面前，质问他的作为。他把搜出了那块金子，然后逼着他继续挖掘宝藏，以为那是他挖出来的金子。不过并没有挖出什么，他们放了他，并在临走时嘲弄道：“差不多两年前就在你呆着的这个地方，我也重复做过一个梦，我梦见自己应该到西班牙的田野上去，寻找一座残破的教堂，一个牧羊人经常带着羊群在那里过夜，圣器室所在的地方有一棵无花果树，如果我在无花果树下挖掘，一定能找到一笔宝藏，但是我可没那么蠢，不会因为重复做了同一个梦就去穿越一片大沙漠。”
男孩吃力的爬起来，他笑了，心中无比幸福，因为他已经找到财宝了。
男孩在夜幕降临时赶到了那座废弃的教堂。无花果树仍生长在圣器室所在的位置。现在他又来到这里，没带羊群，而是带了拿铁锹。一个小时后，他面前出现了一只装满西班牙古金币的箱子。
生活对追随自己天命的人真的很慷慨，男孩想。
风刮了起来。是地中海东风，来自非洲。它并未带来沙漠的气息，也没有带来摩尔人入侵的凶讯，他带来了一股男孩非常熟悉的香味和一个甜蜜的亲吻，这个吻徐徐的，徐徐的来到面前，落在他的双唇上。
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