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微生物组项目设计三-医口分组举例

微生物组项目设计三-医口分组举例

作者: 凌恩生物 | 来源:发表于2022-05-23 09:36 被阅读0次

    大家好!

    今天的内容呢,跟大家分享下医口实验设计的常见“套路”。

    从分组设计上讲,单一变量原则是一样的,所以医口方向的简单设计也是循着同样的“套路”进行,例如:

    不同年龄人群的肠道微生物调研

    这是基于人类群体的研究,那么临床上也多见一些疾病研究,比如近年来持续火热的消化道疾病等,可以做简单的疾病状态和健康状态差异性比较,也可以结合病程发展,研究疾病发生发展过程的微生物组变化,例如:

    某一疾病不同病程的患者肠道微生物调研

    同样的,结合不同的变量研究目的,在开展临床研究的过程中,也可以进行一些横向纵向的交叉研究,这样可以令我们的实验研究更加细致和深入,说明的问题也更透彻,例如某种疾病的发病年龄呈现一定的规律(eg.30-39岁及60-70岁高发),那么在不同发病年龄和不同的疾病状态下,微生物组的变化又是怎样的呢?我们就可以设计这样一个实验:

    某种疾病在发病高峰年龄段患者肠道微生物组调研

    这样一来,横向和纵向上同样都可以进行比较分析,寻找共性和特性,进而确定两个变量因素的作用。

    医口的研究暂时不建议引入太多的变量因素进来,一方面是大量的数据分析结果需要结合临床数据进行汇总分析,对医学方向的老师们来说工作压力剧增;另一方面,由于临床人体样本的不可控干扰因素还是比较大的,诸如遗传,饮食及生活习惯,体质特征等等,都可能潜在影响微生物组的分布而不便于控制。所以大样本量和少变量因素对于快速获取可用信息还是至关重要的。

    同样的,由于各种干扰因素存在,所以在样本选择上医口研究也需要特别留意人体样本的背景一致性,诸如志愿者的年龄结构、性别、体征指数(BMI)等等,尽量的限定在一致性的范围内,这样对增加实验的成功率很有帮助哦。

    好啦,医口的分组设计就先讲这些。设计好实验分组之后,就是我们的取样和样本量设置的问题。相信大家也在上述分组演示中特别留意到了样本量的这一栏,这也是我们项目设计的关键问题,条姐将在下一次分享中跟大家聊聊取样和样本量设置的事儿。


    微生物组项目设计一

    微生物组项目设计二

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