【生信知识】---CNV识别软件评测专题（二）

前言：CNV识别软件评测专题（一）指路👉www.jianshu.com/p/ca856b55e6bf。

2.PennCNV2
编程语言： C++
发表杂志：Bioinformatics
官方网站：http://penncnv2.openbioinformatics.org/en/latest/
软件原理：

软件安装：
1.下载软件

git clone https://github.com/WGLab/PennCNV2.git

2.配置环境：

GNU C compiler (gcc/g++)
GNU scientific library (http://www.gnu.org/software/gsl/)
Boost C++ libraries (http://www.boost.org)

3.配置locations.mk文件：

BOOST_INC_FLAGS = -I/home/kaiwang/usr/boost/boost_1_58_0/
BOOST_LIB_FLAGS = -L/home/kaiwang/usr/boost/boost/lib

GSL_INC_FLAGS = -I/home/kaiwang/usr/gsl/gsl/include
GSL_LIB_FLAGS = -lgsl -lgslcblas -L/home/kaiwang/usr/gsl/gsl/lib

4. make安装

cd PennCNV2-1.0.0/
make