胃癌（GC）是最常见的恶性肿瘤之一，也是全球癌症相关死亡的第三大原因。但是，由于对其发病机制仍缺乏了解，新的治疗策略发展缓慢，我国的胃癌发病率和死亡率仍然处于排名前三。长链非编码 RNA (lncRNA) 是一类长度超过 200 nt 的非编码 RNA。它们通过调节参与增殖、分化、凋亡、细胞周期、侵袭、转移、DNA损伤和致癌作用的基因的表达，在广泛的生理和病理过程中发挥着至关重要的作用。已在各种癌症类型中发现了 lncRNA 的异常表达。越来越多的证据表明，lncRNAs参与了GC发病机制的许多方面，包括其发生、转移和复发，表明它们作为新型生物标志物在GC的诊断、预后和治疗靶点方面的潜在作用。理解lncRNA 的生物发生、生物学特性和功能，并强调了它们在 GC 中的关键作用和临床意义可能有助于转化研究成果，开发更好的 GC 诊断和治疗方法。
Long non-coding RNAs: Biogenesis, functions, and clinical significance in gastric cancer - PubMed (nih.gov)
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随着RNA测序和生物信息学的快速发展，已经鉴定出大量的lncRNA。这些 lncRNA 有一些共同的生物学特征，包括以下。
(1) lncRNA 已被证明在从原核生物到哺乳动物的所有生物体中高度丰富表达。
(2) lncRNA 在原核和真核细胞中广泛表达，并且具有广泛的多样性。据报道，人类中约有 5,400 到 10,000 多个 lncRNA 转录本。 其中一些类别是由基因组中不同的 DNA 元件产生的，包括启动子、增强子、基因间区域和蛋白质编码基因的相反链，而另一些则是由基因组中不同的 DNA 元件产生的。由具有非经典 RNA 加工途径的长初级转录物产生。
(3) lncRNA 的表达包括更强的细胞类型，与蛋白质编码基因相比，具有组织和时空特异性。
(4) lncRNA 基因的表达频率较低在人类中比 蛋白质编码基因。
(5) 大多数lncRNA基因在进化过程中相对保守，它们的进化速度比蛋白质编码基因快。 lncRNA在一级序列中的保守性较低，其序列相似性主要保留在二级结构中。
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lncRNA的基因组起源分类
(A) 正义或 (B) 反义 lncRNA 位于相同或相反链上相关蛋白质编码基因的外显子内或与其重叠。反义 lncRNA 与蛋白质编码基因的转录方向相反。 (C) 双向 lncRNA 位于相关蛋白质编码基因的启动子附近（1 kb 内）并以相反方向转录。 (D) 内含子 lncRNA 来自长内含子，并从相关蛋白质编码基因的内含子内部转录。 (E) 基因间 lncRNA 来源于两个蛋白质编码基因的基因间片段。
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(A) 信号 lncRNA 可以作为分子信号响应不同的刺激。这种原型中的 lncRNA 通过直接与 DNA 结合或与激素受体 (HR) 或转录因子 (TF) 结合来调节基因在空间和时间上的表达。 (B) 诱饵。这种原型中的 lncRNA 充当 miRNA 或 TF 的蛋白质诱饵，以防止这些分子与其靶标结合。 (C) 脚手架。 lncRNA 可以作为支架与不同的蛋白质伴侣形成核糖核蛋白复合物，从而调节其靶基因的转录。 (D) 指南。这种原型中的 lncRNA 可以通过将核糖核蛋白复合物引导至其靶基因来调节基因表达。 (E) SINEUPs。这种原型中的 lncRNA 可以通过招募 PTBP1 和 HNRNPK 来增加其靶 mRNA 的翻译，从而形成对靶 mRNA 水平没有影响的翻译起始复合物。
GC的LncRNA
lncRNA对GC信号通路的调控
lncRNA通过调节参与致癌信号通路的关键成分的表达参与GC进展，包括PI3K/AKT (A)、Hedgehog (B)、Wnt/β-catenin (C)、Notch (D)、STAT3 (E) )、MAPK (F)、p53 (G) 和 NF-kB (H) 信号通路。
Reference：
Liu Y, Ding W, Yu W, Zhang Y, Ao X, Wang J. Long non-coding RNAs: Biogenesis, functions, and clinical significance in gastric cancer. Mol Ther Oncolytics. 2021 Nov 11;23:458-476. doi: 10.1016/j.omto.2021.11.005. PMID: 34901389; PMCID: PMC8637188.
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