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MCPcounters包踩坑记录

MCPcounters包踩坑记录

作者: 小狼小狼_e211 | 来源:发表于2021-01-21 11:16 被阅读0次

下载

library(devtools)
install_github("ebecht/MCPcounter",ref="master", subdir="Source",force = T)
library(MCPcounter)

下载起来毫无问题所以导致后面的报错让我一脸懵逼

运行示例文件

MCPcounter.estimate <- MCPcounter.estimate(
MCPcounterExampleData,
featuresType=c('affy133P2_probesets','HUGO_symbols','ENTREZ_ID')[1],           
probesets=read.table(curl('http://raw.githubusercontent.com/ebecht/MCPcounter/master/Signatures/probesets.txt'),sep='\t',stringsAsFactors=FALSE,colClasses='character'),
genes=read.table(curl('http://raw.githubusercontent.com/ebecht/MCPcounter/master/Signatures/genes.txt'),sep='\t',stringsAsFactors=FALSE,header=TRUE,colClasses='character',check.names=FALSE)
)

然后报错

Error in open.connection(file, "rt") :    schannel: failed to receive handshake, SSL/TLS connection 
以及
Could not resolve host: raw.githubusercontent.com

查了下应该是DNS污染的问题

解决:

先在这里查询一下地址
https://www.ipaddress.com/
查到raw.githubusercontent.com的IP是199.232.96.133
打开win10命令提示符,输入

cd C:\Windows\System32\drivers\etc\
notepad hosts

修改host文件
添加

199.232.96.133 raw.githubusercontent.com

重新运行Rstudio

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