寺和庙是不一样的。
庙是中国古代祭祀天地鬼神的地方。皇帝有太庙，民间有土地庙，龙王庙等等。而寺是古代的行政单位。比如大理寺，是主管考核官员的。鸿胪寺，是主管外交的。
永平十年，汉明帝派特使把两位法师迎请到了中国，开始就是鸿胪寺负责接待的。后来因为佛教受到朝野普遍的欢迎，就把两位法师留在了中国，另在洛阳设一新寺，就是白马寺，这是中国第一个佛寺，是当时朝廷直属的行政机构。它的目的就是翻译经典，再一个就是指导大众共同修行。
历史上的佛寺，相当于现在的大学，它的目的是普及教育。佛寺里面有藏经楼，起到了现在公共图书馆的作用。里面不单单佛教经典，儒家道家的经典都有收藏。很多读书人，象王阳明、朱熹、范仲淹这些大儒，都曾长时间在寺院里挂单读书。而且寺院定期有佛法的讲座，当地老百姓都可以去听，这是起到普及佛法的作用。也是大众共同修行的一个场所。
寺院里的出家人，相当于现在大学里的专职教授。学佛选择出家或者在家，这是分工的不同。出家只是选择做专职弘扬佛法的工作而已。这就好比现在有人选择在学校里教书，也是专职做传播知识的工作，这是一样的道理。但是学佛不一定非要出家，就好像学知识不一定非要当老师。出家人也不一定比在家人高明，就好像当老师未见得一定比其他职业知识渊博，这是同样的道理。诸位可以读读《居士转》《女居士转》，这些在家人的成就甚至还超过出家人。
近百年来，佛教受到冲击，大众甚至佛教徒对于传统佛教都有很大的误解。最明显的误解，一个是供奉佛像，一个是给庙里捐钱。寺庙里供奉佛像，相当于私塾里供孔子像，又好比美国人把四位总统像雕在岩石上，或者是在蜡像馆收藏。塑像的一个目的是纪念老师，再一个就是见贤思齐，用老师的形象提醒自己用功。并不是把佛像当神明看待。至于寺院捐钱，这是印度僧团乞食制度在中国的本土化。
古时候，有两种职业是不明码标价的，一是老师，一是医生。老师教学生，或者医生看病，学生和病人都是随分给的，有钱多给一些，没钱少给一些。前面讲了，佛教寺院相当于是社区大学，它本身也不明码标价。就摆一个功德箱，大家也是随分给，相当于大众集资办学。因为中国不象印度，印度是在佛教出现之前就有比丘行乞的风俗。而中国的文化背景不同，形式需要根据环境而改变。因为寺院的钱是用来办教育的，给寺院捐钱相当于支持教育，这是做了很大的好事，但却谈不上功德。
按佛法的原理来讲，功德是从定中来的，不是从布施做善事来的。历史上梁武帝造四百八十寺，达摩祖师也说并无功德。
再说和尚。现在和尚成了通用名词，泛指出家人。其实佛门里面，和尚是个非常尊贵的称呼。一个寺院的主持，或者是一方的道场的主讲人，才称为和尚。
再说合什，合什是佛门一个礼节，它是代表把纷乱的心思收束住。我们平时十指是张开的，现在把它合拢在一起，这就是代表集中，代表定。定是佛法修行的核心，所以这个礼节有很深的寓意在。就好像基督徒划十字，也有它的寓意。佛门一举一动，都有它的寓意，但这里面没有神秘和迷信。
“寺”的本义是宦官和官吏办公的处所。《经典释文》中说：“寺，本亦作侍。寺人，奄人也。”奄即宦官，后来称太监，故“寺”最初的本义是从“侍”这一意义而来的，乃是宦官的意思。
《说文》云：“寺，廷也。”
《汉书》注：“凡府廷所在，皆谓之寺。”如汉代的御史府，也称御史大夫寺，中央一级的常设机构有太常寺、大理寺等。秦汉两代建立的“三公九卿”制，三公的官署称为“府”，九卿的官署称为“寺”，即所谓的“三府九寺”。汉代，九卿中有“典客”，后又改称为“大鸿胪”。鸿胪卿的职责是布达皇命、应对宾客，其官署即“鸿胪寺”。
东汉明帝永平十年（公元67年），印度高僧摄摩腾和竺法兰跟随汉王朝派往西方寻找神佛的使臣，用白马驮着佛经和佛像来到了洛阳。这两位印度僧人被安排到接待诸王和外国人的鸿胪寺居住。第二年，汉明帝下令在洛阳城雍门西面，按天竺僧伽蓝摩（该梵语的意思是“僧众所住的园林”）样式为这两位印度僧人建造了一些房屋，这些房屋依照当时的习惯，也被东汉王朝称为“寺”。因为寺内的经书是用白马驮来的，朝廷便将其命名为“白马寺”。这样，洛阳的白马寺就成为中国的第一座佛寺。
隋唐以后，寺作为官署的称谓越来越少，而逐渐演变为中国佛教建筑的专用名词。
“庙”的历史比“寺”更为悠久，因为它是中国人供祭祖宗神位的屋舍，故又称为“宗庙”。
《礼祀·祭法》中说：“天子至士，皆有宗庙”、“天子七庙，卿五庙，大夫三庙，士一庙。”
在古代，“太庙”是帝王的祖庙，其他凡有官爵的人，也可按制建立“家庙”。汉代以后，庙逐渐成为祭祀中国的一切圣贤、神灵的处所，如孔庙、武侯庙、关帝庙、岳王庙、龙王庙、孟姜女庙、屈原庙、妈祖庙、山神庙、土地庙、城隍庙等。中国古代，差不多每一座城池都有一个城隍庙，而庙中所建“尸主”，大多有姓名可查，如上海城隍庙的“尸主”为元末明初的“东海名士”秦裕伯，昆明城隍庙（原址在今“五一电影院”）的“尸主”为明代大臣于谦。
另外，皇宫的前殿也称为庙，所以朝廷也称为“庙堂”、“庙廊”。如宋代著名文学家范仲淹就有名句：“居庙堂之高，则忧其民；处江湖之远，则忧其君。”
主要参考文献：《中国佛教史》《道教大辞典》《中国道教思想史》《天师道与滨海地域之关系》《崔浩与寇谦之》《尧典·义和章》《尚书·顾命》《五行说探源》《五行原始意义及其纷歧蜕变大要》
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