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安装 CosmMC

安装 CosmMC

作者: lekf123 | 来源:发表于2016-08-13 22:39 被阅读0次

<在 linux 系统中安装宇宙学程序包---CosmoMC>

编译器安装(ifort)

本人有2013的激活文件和程序,但是程序需要2015以上的版本,所以先安装2013,激活,再安装2015版本,可自动激活。

$ tar xzvf parallel_studio_xe_2013_update2.tgz
$ cd parallel_studio_xe_2013_update2
$ ./install.sh
" 激活程序时选择使用文件激活,中间需要给出集或文件 ‘*.lic‘ 的位置,
" 直接给出文件位置,比如'*.lic'文件在 Downloads,输入
" /home/***/Downloads/
" 其中'***'是本人主文件夹
" 输入安装文件夹位置默认 '/opt/intel',自己的电脑可以直接选择默认位置
" 安装完成'Quit'
" 卸载掉 2013 版本,集或文件会遗留在电脑里
$ cd /opt/intel/Parallel_studio/
$ sudo ./uninstall.sh
" 完全卸载 '0'
" 再次安装 2015 版本,安装时激活选择使用默认激活
$ tar xzvf l_fcompxe_2015.3.187.tgz
$ cd l_fcompxe_2015.3.187
$ ./install.sh
" 同样过程,安装完成后,编辑主文件夹下的'.bashrc'文件
$ cd
$ vim .bashrc
" 在文件最后增加上这么一行:
" source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64
" 保存并退出 ':wq',然后 source 一下
$ source .basrc
查看是否安装成功
$ ifort --version 
" ifort (IFORT) 15.0.3 20150407
Copyright (C) 1985-2015 Intel Corporation.  All rights reserved.
" 出现以上信息,表明安装从成功,环境设置成功。

安装并行软件 --- openmpi

下载软件 openmpi_2.0

" 解压文件
$ tar xzvf openmpi-2.0.0.tar.gz 
$ cd openmpi-2.0.0
$ ./configure --prefix=/usr/local/openmpi F77=/opt/intel/composerxe/bin/ifort FC=/opt/intel/composerxe/bin/ifort F90=/opt/intel/composerxe/bin/ifort 
" prefix 后面是安装位置,本人选定在'/usr/local/'文件夹中,'openmpi'是自己给定名字,可自动生成
$ make
$ make install
" 添加环境变量
$ cd
$ vim .bashrc
" export PATH=/usr/local/openmpi/bin:${PATH}
$ source .bashrc
" 检测是否成功
$ cd openmpi-2.0.0/examples
$ make
$ mpirun -np 4 hello_c

cfitsio 安装 (A FITS File Subroutine Library)

下载

$ tar xzvf cfitsio_latest.tar.gz
$ cd cfitsio_latest
$ ./configure --prefix=/usr/local/cfitsio
$ make shared
$ sudo make install
" 修改环境变量,添加
$ cd 
$ vim .bashrc
" 文件最后添加
" export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cfitsio/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
  • Planck, WMAP, Healpix 及主程序 CosmMC 安装 待续……

安装 planck 2015 【plc-2.0】

安装时一定先看看 readme 文件

使用 waf 安装

./waf configure --wmap_src=/home/cosmos/opt/WMAP --cfitsio_prefix=/home/cosmos/opt/cfitsio --lapack_mkl=$MKLROOT --lapack_mkl_version=10.3
./waf install

将环境加入 .bashrc

source /home/cosmos/opt/Planck/plc-2.0/bin/clik_profile.sh

使其生效

source ~/.bashrc

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