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WGCNA分析 | 全流程代码分享 | 代码三

WGCNA分析 | 全流程代码分享 | 代码三

作者: 小杜的生信筆記 | 来源:发表于2023-02-25 21:12 被阅读0次

关于WGCNA的分析,共有3期教程,今天是的第三期。前面两期是使用代码进行分析的,也是我们的平时最常用的分析方法,对我个人来说也是最简洁的方法。(PS:对于使用代码分析,个人有个人的看法。如果你看得懂代码,那么是非常方便的;但是,一旦你遇到超出你能力范围的代码,就需要你获得别人的帮助


WGCNA分析教程一


[WGCNA分析教程二]((https://mp.weixin.qq.com/s/Ln9TP74nzWhtvt7obaMp1A)

我们的前面两个教程是付费教程,对于这个价格是否值得,就是仁者见仁,智者见智

上面的教程,所有代码都原封不动的附上,只需改动几个参数就可以;如果,你连需要改那几个参数都不知道,那么请看我每个教程的视频解析;那么,仍然不知道,我们也没办法了


今天的教程是来自TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,作者已经提供了详细的使用教程,也是非常方便的。直接按照作者的操作分析即可。你考虑的问题,作者大佬都给你考虑到了!!
具体请自己详细看一下。

作者代码存放位置:在GitHub中(https://github.com/ShawnWx2019/WGCNA-shinyApp


自己使用作者教程安装时遇到的问题

我们在TBtools使用WGCNA shiny插件,启动后会进行安装相关的包,但是也许我的环境问题,一直安装不上,出现报错的情况。


当你遇到这样的情况,我们最好的解决办法就是直接使用作者的代码在Rstudio中的运行即可,运行成功后直接跳出可视化操作框。

运行成功后的界面


那么后的操作就按作者的教程进行即可TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」但是,很多的操作还是需要自己来摸索。

前面WGNCA的教程:

WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一

WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码二


小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!

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