1. 实验室平面图
图5:肿瘤诊断实验室平面图
2. 技术流程图
图6:肿瘤诊断技术流程图
图7:一代测序实验流程图
3. 技术参数
1.分区功能
1.1试剂准备区
主要功能:在NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。
1.2标本与文库制备区
主要功能:样本接收、样本前处理、全基因组DNA提取以及各种样本DNA或者RNA的提取、DNA片段化、DNA纯化、DNA浓度测定、DNA片段的末端修复与纯化、接头连接与纯化。
1.3DNA打断区
主要功能: DNA打断(片段化)。
1.4电泳区
主要功能: 片段化DNA电泳检测及结果反馈。
1.5杂交捕获区(扩增一区)
主要功能:目的DNA片段的杂交捕获与纯化,Sanger测序目的片段扩增与纯化、Sanger测序PCR前准备。
1.6文库扩增区(扩增二区)
主要功能:杂交捕获后扩增与纯化、文库浓度质检分析、及Sanger测序的PCR扩增反应与纯化。
1.7测序区
主要功能:测序模板制备(乳液PCR与磁珠富集回收)、上机测序、及Sanger测序。
2.仪器配置
2.1试剂准备区
主要仪器设备:加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。
2.2标本与文库制备区
主要仪器设备:微量台式离心机、掌上三管离心机、恒温金属浴、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit 2.0核酸定量仪、PCR仪、电脑(可连接互联网)、条形码打印机、普通打印机、扫描枪等。
2.3DNA打断区
主要仪器设备:Covaris S220超声波打断仪、冰箱、掌式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯等。
2.4电泳区
主要仪器设备:电泳仪、微波炉、凝胶成像仪、冰箱、掌式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯等。
2.5杂交捕获区(扩增一区)
主要仪器设备:PCR仪、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器等。
2.6文库扩增区(扩增二区)
主要仪器设备:PCR仪、Qubit 2.0核酸定量仪、微量台式离心机、掌上三管离心机、涡旋震荡器、移液器、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、磁力架等。
2.7测序区
主要仪器设备:高通量测序仪、Sanger测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫外灯、磁力架、PCR仪等。
SICOLAB实验室整体设计建设:包含洁净净化工程、通排风工程、特殊供水供气工程、电气工程、门禁及网络工程、智能化控制工程、实验台柜定制工程、实验室装修装饰工程、实验室废气处理工程。
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