5家公司使用AI对抗冠状病毒,利用深度学习模型预测可能成功治疗COVID-19的新旧药物。
截至周四下午,在美国有10,985例确诊的COVID-19病例和零FDA批准的药物来治疗感染。DARPA致力于短期“防火”对策,而计算科学家则跟踪该病毒新病例的来源,但许多药物发现公司正在利用其AI技术来预测哪些现有药物或全新的类药物分子,可以治疗病毒。
从概念到市场,药物开发通常需要至少十年的时间,并且失败率超过90%,价格在2到30亿美元之间。“我们可以使用AI大大加快这一过程,并使其变得更便宜,研发更快并且研发成功率更高,”专注于药物发现的AI公司Insilico Medicine首席执行官艾利克斯·扎沃罗恩克夫说道。
1、迪尔根(Deargen)
2月初,总部位于韩国的迪尔根(Deargen)的科学家,发表了预印本论文(该论文尚未经过其他科学家的同行评审),其结果来自基于深度学习的模型MT-DTI。该模型使用简化的化学序列而不是2D或3D分子结构来预测目标分子与靶蛋白结合的强度。该模型预测,在可用的FDA批准的抗病毒药物中,HIV药物阿扎那韦最有可能结合并阻断SARS-CoV-2(引起COVID-19的病毒)外部的突出蛋白。它还确定了可能与该病毒结合的其他三种抗病毒药。该公司的联合创始人朴宋树表示,虽然该公司不知道任何官方机构会按照他们的建议进行后续行动,但他们的模型还预测了几种尚未批准的药物,例如抗病毒药物remdesivir,目前正在对患者进行测试。Deargen的CTO提到,Deargen现在正在使用他们的深度学习技术来生成新的抗病毒剂,但他们需要合作伙伴来帮助他们开发分子。他说:“我们目前没有测试这些候选药物的工具。”“如果有制药公司或研究机构想要测试这些候选药物的SARS-CoV-2,他们十分欢迎。”
2、Insilico药物公司
硅医学同样地,总部位于香港的Insilico Medicine于2月初通过预印本纸进入该领域。该团队没有寻求重新利用现有药物的方法,而是使用基于AI的药物发现平台来生成成千上万的新型分子,这些分子具有结合特定SARS-CoV-2蛋白并阻止病毒复制的潜力。深度学习过滤系统缩小了范围。Insilico首席执行官艾利克斯·扎沃罗恩克夫说:“经过4天的AI冲刺,我们发布了最初的100个分子。”
艾利克斯·扎沃罗恩克夫告诉记者,自那时以来,Insilico已合成了这七个分子中的两个,并计划与制药合作伙伴在接下来的两周内对它们进行测试。该公司还正在将其AI平台许可给两家大型制药公司。Insilico还积极研究可能会改善老年人免疫系统的药物-因此,老年人可能会像年轻人一样对SARS-CoV-2感染做出反应,症状更轻,恢复更快-以及有助于术后恢复肺功能的药物感染。他们希望尽快发布其他结果。
3、SRI 生物科学与Iktos公司
3月4日,位于门洛帕克的研究中心SRI International,和位于巴黎的AI公司Iktos宣布了一项合作,期待一起发现和开发新的抗病毒疗法。Iktos的深度学习模型设计虚拟新型分子,而SRI的SynFini自动合成化学平台则提供了制造分子的最佳方法,然后再制造出来。
Iktos首席执行官亚恩·查世顿表示,结合它们的强大功能,这些系统可以在1-2周内设计,制造和测试新的类药物分子。他告诉媒体,基于AI的候选药物的生产目前正在进行中,``第一轮目标化合物将很快移交给SRI的SynFini自动合成平台。''Iktos最近还发布了两个基于AI的软件平台来加速药物发现:一个用于新药设计,另一个用于免费的在线Beta版,以帮助合成化学家解构如何更好地构建化合物。Gaston-Mathé说:“我们渴望在这个免费平台上吸引尽可能多的用户,并获得他们的反馈,以帮助我们改进这一年轻技术。”
4、Benevolent人工智能
2月,英国AI初创公司Benevolent AI发表了两篇文章,一篇在《柳叶刀》杂志上发表,另一篇在《柳叶刀传染病》杂志上发表,指出了批准的药物可能会阻断SARS-CoV-2的病毒复制过程。该公司的AI系统使用庞大的医学信息库,包括通过机器学习从科学文献中提取的数据,从而识别出6种有效阻止细胞途径的化合物,这些途径似乎可以使病毒进入细胞内,从而制造出更多的病毒颗粒。作者写道,这六种药物之一是巴立替尼(baricitinib),一种经批准用于治疗类风湿关节炎的每日一次的药,在抗SARS-CoV-2的安全性和有效性方面似乎是该组中最好的。
Benevolent的联合创始人伊万·格雷费恩告诉记者,Benevolent已与制造药物的药品制造商联系,以将其作为一种潜在的治疗方法进行测试。目前,通过类似机制起作用的药物正在COVID-19的临床试验中。
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