相信各位做单细胞的童鞋们，都遇到过去除多细胞的情况，而Cellranger默认的是前1%（3000cell），对于...[作者空间]
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在...[作者空间]
sample dataset：下载Single-cell analysis of mouse cortex或者GE...[作者空间]
SCENIC:Single Cell rEgulatory Network Inference and Clust...[作者空间]
10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实s...[作者空间]
00 缘起 最新的R 3.5 版本特别难安装，而且很多新的包只能在R3.5版本上工作。之前用 make sourc...[作者空间]
最近考种数据回来了，今年测得单株，本想用箱线图表示，后来一并把小提琴图也做了，顺便做个笔记吧。 利用SUMIF对相...[作者空间]
生物信息分析中，接触最多的莫过于基因富集分析，故在此基础上目前已经开发了很多种富集分析工具，如网页版的DAVID、...[作者空间]
加载所需R包 构建测试数据集 使用Heatmap函数绘制热图 使用HeatmapAnnotation函数构建注释对...[作者空间]
使用ggscatter函数绘制散点图 加载所需R包 基本用法： Usage 常用参数： Arguments 使用示...[作者空间]
1、加载需要的包 2、导入数据 我这里的数据其实就是一列基因名，是通过其它分析挑选出来的几百个基因，想要看看这些基...[作者空间]
原创 2018.5.31 星期四 小雨 biolearn 如何利用 R 实现从 A 图到 B 图？ 只需...[作者空间]
R 相关性分析 1. 相关性矩阵计算： 加载mtcars数据 计算两两相关系数 计算矩阵相关系数 2. 相关系数的...[作者空间]
本文主要利用ggpubr包来探索基因组数据,主要是可视化TCGA基因组数据的基因表达谱。 TCGA是一个包含大量癌...[作者空间]
上篇文章中提了一下如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记,本文将详细介绍。利用数据...[作者空间]
1.利用facet_grid 代码如下：准备数据ini<-read.table('ini')fina<-read....[作者空间]
