经常在报道基线资料时候，会设计表格，需要摘录统计结果，非常麻烦的调整表格。今天本文章利用compareGroups...[作者空间]
肿瘤微环境是近年来的研究热点。复杂而动态的微环境中，肿瘤细胞与浸润性免疫细胞、基质细胞等相互作用，这在促进或抑制肿...[作者空间]
做通路富集分析常需要批量进行基因ID转换，总结了3种简便方法与大家分享。方法1和2依赖于基因组注释R包，如果无相应...[作者空间]
随着数据挖掘的高涨，大量ceRNA网络的文章不断涌现，感觉好像要烂大街的节奏，但仔细阅读ceRNA的相关文章还是有...[作者空间]
MOVICS包整合多组学数据进行分析，其安装的过程太让人心酸，大家安装的过程慢慢体会，下面就来学习下这个由“大鱼海...[作者空间]
基本知识 通过一定的统计学方法对试验组与对照组进行筛选，使筛选出来的研究对象在某些重要临床特征(潜在的混杂因素)上...[作者空间]
author: "Hannisal"date: "2020/10/4" 【TCGA数据库简介】 TCGA是美国国家...[作者空间]
1.评估分类方法的性能 拥有能够度量实用性而不是原始准确度的模型性能评价方法是至关重要的。 3种数据类型评价分类器...[作者空间]
之前画双Y轴的图都是自己写函数用ggplot2去制作，偶然间发现了ggpubr包一种可视化的形式，大家可以一起学习...[作者空间]
之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数...[作者空间]
背景基础 箱线图的解释： 添加p值的需求 这样的箱线图，添加p值的需求是很多见的，核心就是stat_compare...[作者空间]
重新装完R 3.6.2之后，发现xlsx 和rJava两个包都不能加载，觉得是不是自己没装Java的问题，便在官网...[作者空间]
基因集富集分析(Gene set enrichment analysis, GSEA)方法于2005年首次提出，题...[作者空间]
之前写过用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作图，但是图没有最新版...[作者空间]
趁疫情被封闭在家，学习一下python，之前尝试过看过perl的书，代码看得我一脸懵逼，python乍看上去和蔼可...[作者空间]
