Introduction 上一篇里通过Metabat2了解了宏基因组分箱的关键步骤，这篇文章将介绍一个更全面的bi...[作者空间]
Introduction 宏基因组学是直接从环境样本（如土壤、水、肠道内容物等）中回收遗传物质并进行研究的学科，无...[作者空间]
上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法[https://www.jianshu.com/p/b6c4d3376bc9]，也埋下一个小坑：复现文章里好看的树，现在过来填...[作者空间]
Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本（2024.03.03） 增加Mmseqs2用于去冗余，基因聚类的速度非常快，且随序列量线性增长（2024.03.12...[作者空间]
Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性（Average Nucleotide Identity），...[作者空间]
Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一个专注于基因组分类学的数...[作者空间]
Introduction 上次简要介绍过了微生物组中生物合成基因簇（BGCs）分析[https://mp.weixin.qq.com/s/4eH0zSR9B-iBZRUUs8...[作者空间]
我们实验室的子诺师姐开发了一种新型的用于个体生物和化学暴露组纵向测绘的可穿戴被动采样器：AirPie。目前可以在一个驱蚊扣差不多大小的device上分析出数千种化合物和微生物...[作者空间]
最近，我开发的R包ReporterScore（GRSA方法）发表在Briefings in Bioinformatics上了，这是一种灵活的，可用于复杂多组学数据的功能富集新...[作者空间]
Introduction The Earth Microbiome Project (EMP) 是一个旨在描述和解释地球上微生物多样性的国际性科学计划。这个项目的目标是通过对...[作者空间]
Introduction ordination analysis（排序分析）是生态学和统计学领域中用于分析和解释多变量数据的方法之一。这个方法通常被用于探索和可视化生态学或生...[作者空间]
Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Ency...[作者空间]
Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Ency...[作者空间]
Introduction 上次已经在一篇推文[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkwMjQxODQ5MA==&mid=2247484945...[作者空间]
Introduction 抗生素 抗生素是一类药物，用于治疗或预防由细菌引起的感染。它们通过抑制细菌的生长或杀死细...[作者空间]
更新 查看新版：宏基因组分析流程（Metagenomic workflow）202405｜持续更新 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...[作者空间]
Introduction 了解控制群落多样性、功能、演替和生物地理学的机制是生态学，尤其是微生物生态学中的一个核心。推荐阅读综述： Zhou, J. & Ning, D. S...[作者空间]
这篇文章主要是介绍绘制进化树用的ggtree以及一些拓展包的基础用法，因为gg系列绘图的逻辑基本是搭积木，这种介绍性的文章能够帮助快速的找到想要的“积木”以及拼接的方法，剩下...[作者空间]
