本次学习资料来源，结合视频观看效果更佳，视频相关代码如下： 视频如下：https://www.youtube.co...[作者空间]
单个样本分析接上一篇：Python图文复现2022||02-数据介绍与下载[https://www.jianshu...[作者空间]
学习资料来源：anndata主页：https://anndata-tutorials.readthedocs.io...[作者空间]
一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言，RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到的上游软件就...[作者空间]
scanpy也可以使用harmony，但是其实调用的Harmonypy这个包,其实使用的话倒是比较简单，就是下面这...[作者空间]
在RNAseq的下游分析中，一般都会将上游处理完得到的原始counts数转变为FPKM/RPKM或是TPM来进行后...[作者空间]
课题需要某一篇已发表文章的基于10x Genomics平台的scATAC-seq数据，于是乎，开始了踩坑指南。 N...[作者空间]
hello，又是周一，新的开始，今天是二月二十八日，对于台湾同胞来说是一个沉重的日子，时间很快，快到我们毫无感觉就...[作者空间]
所有信息可以查看github[https://github.com/sqjin/CellChat]教程有很多，最基...[作者空间]
R语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.c...[作者空间]
scWGCNA是一个生物信息学工作流程，是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucl...[作者空间]
分析过程 以rela基因为例，featureCounts结果文件“all.id.txt”中提供的信息为： 接下来用...[作者空间]
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Im...[作者空间]
在看文献Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presentin...[作者空间]
Single-nucleus transcriptome analysis reveals dysregulati...[作者空间]
前言 往往在每一篇单细胞文章的Figure 1中，我们都可以看到一个描绘细胞在cluster或者在样本的含量图。因...[作者空间]
挖掘公共单细胞数据集时，会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下，方便自己日后调用，以创建Seurat对象（1...[作者空间]
1. 数据和基因集准备 数据准备 基因集准备 使用AverageExpression函数提取分组平均表达矩阵 2....[作者空间]
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间...[作者空间]
参考：https://satijalab.org/seurat/articles/essential_comman...[作者空间]
