单行命令，化繁为简，重剑无锋，大巧不工。接下来学习生信实用单行命令。 基础awk和sed命令 sed: strea...[作者空间]

笔者最近遇到几起在Shell中使用EOF来定义一块执行脚本，终于可以大大减少代码量和增强逻辑性，现在将其总结分享出...[作者空间]

一.locate（搜索文件） 1.命令格式 locate 文件名 说明：locate命令不在系统中搜索文件（即不遍...[作者空间]

在实际运行中，将一个写好的脚本部署到生产系统上，但碍于保密或者密码泄露问题，需要将脚本打包封装。现在总结两种脚...[作者空间]

前言   对于用Linux来处理数据的用户来说，应该都知道Linux处理数据的三个强有力的命令awk、sed、gr...[作者空间]

在NGS基础：测序原始数据下载一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump从NCBI下载原...[作者空间]

【生信技能树】sam和bam格式文件的shell小练习 LINUX练习题 统计共多少条reads(pair-end...[作者空间]

简单的语句 两文件的交集和差集 例子 aaa.txt文本 bbb.txt 求aaa.txt和bbb.txt的差集 ...[作者空间]

听老大哔哩哔哩视频中的linux文本处理的部分，其中讲到三驾马车（grep、awk、sed）部分很快就迷糊了，工欲...[作者空间]

文章源地址awk命令是Linux系统里非常强大和功能丰富的文本行处理工具命令，使用方法简单，但是功能丰富，处理文本...[作者空间]

snakemake是一个用来编写任务流程的工具，用python编写的，因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂，易于理解...[作者空间]

如果只有一个样本，或者样本量不大的情况下，我会选择一次性投递所有的任务。但是如果有100个以上的样本，那我就得谨慎...[作者空间]

全文6,271字，阅读16分钟。 awk 是处理文本文件的一个应用程序，几乎所有的Linux以及MacOS都自带这...[作者空间]

Ubuntu18.04.2LTS安装、配置、美化 安装准备 准备Ubuntu18.04镜像 关闭Secure Bo...[作者空间]

生信星球狗粮特供：我们的公众号生信星球的开始，就是我正式开始学生信的时候，零星时间看过的东西都会忘，只有找个办法p...[作者空间]

Bioinformatics one-liners生信单行脚本翻译版本[作者空间]

本文的sort命令是GNU版本(8.22), 和BSD的sort不同 sort是我最常用Linux命令之一，它的功...[作者空间]

最近在学习Linux，发现一个不错的网站，可以查询Linux的各种命令。http://www.runoob.com...[作者空间]

最近捣鼓了一下远程连接服务器，这里就分享下基本知识。Linux远程连接，我们常用的工具有Putty、XShell...[作者空间]

1.切割染色体fasta： awk '/^>/ { gsub(">","",$1) FILE=$1 "....[作者空间]