我有时候会对DIffBind的输出结果进行下修改,然后放到HOMER里面去找motif。但我有个不太好的一点就是,...[作者空间]
在前面的count normalization的方法部分,我初步介绍了一些常见的count normalizati...[作者空间]
最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图,所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一...[作者空间]
我们在介绍公共数据库的时候,经常会提到RNA-seq;chip-seq;甲基化芯片的东西。对于不了解高通量测序的同...[作者空间]
文章来自:Concepts and relevance of genome-wide association st...[作者空间]
最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前...[作者空间]
一、背景介绍 通常,BED文件的overlap/intersect的操作,可以BEDtools intersect...[作者空间]
刘小泽于19.2.3首次接触ChIP-Seq中间也没怎么做过相关的项目,不过现在要重拾起来咯,整理一下必备的背景知...[作者空间]
链接:From reads to insight: a hitchhiker’s guide to ATAC-se...[作者空间]
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATA...[作者空间]
此次分析详解专题将讲述以下内容,老规矩,如有理解错误,还请各位大侠批评指正! WGCNA适用于什么分析内容? 表型...[作者空间]
在上一篇中,本来说好的是“如何提取拟南芥(或非模式物种)基因的启动子序列_基于R”,结果却只说了提取拟南芥的情况。...[作者空间]
做富集分析的网页工具https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost用法:把基因列表输入就...[作者空间]
一、下载测序数据 ①SRA数据库[存储二代测序的原始数据]②在进行上游分析时,数据格式转换过程概述如下:sra↓F...[作者空间]
在研究基因转录调控的过程中,科研汪经常需要构建某个基因启动子的荧光素酶报告质粒或者预测与某基因启动子结合的转录因子...[作者空间]
工欲善其事,必先利其器。 ATAC-seq 已然成为表观遗传研究的利器,关于 ATAC-seq,我们可能需要知道以...[作者空间]
ATAC-seq的基础概念 ATAC-seq(Assay for Transposase Accessible C...[作者空间]
Pre:之前整理了一个思维导图见:https://www.jianshu.com/p/0241ccba2f29,进...[作者空间]
BETA 网址: http://cistrome.dfci.harvard.edu/BETA/tutorial.h...[作者空间]
欢迎关注oddxix RNA-seq是高通量测序中最常见的一种应用,本期视频介绍其:1.方法原理2.生物信息分析 ...[作者空间]