1. fastq格式说明 Fastq格式是一种基于文本的存储生物序列和对应碱基(或氨基酸)质量的文件格式。下面是一...[作者空间]
Jain C, Rodriguez-R LM, Phillippy AM, et al (2018) High t...[作者空间]
0. 首先需要获取基因的相对丰度表,这里可以略参考 宏基因组-(1)基因预测与基因相对丰度[https://www...[作者空间]
-3.仅作笔记使用 我所用到的所有脚本可以+Q 840842906索取 注明来意,但是请实名 学校+名字 -2.两...[作者空间]
安装这个Trim Galore软件上之前需要安装好Fastqc和cutadapt两个软件: 1. 安装Fastqc...[作者空间]
一、β多样性分析的概念 Beta多样性指的是样本间多样性。在肠道菌群分析中,Beta多样性是衡量个体间微生物组成相...[作者空间]
文献代表 标题:Elevated rates of horizontal gene transfer in the...[作者空间]
1. metaWRAP简介 [MetaWRAP](https://github.com/bxlab/metaWRA...[作者空间]
简介 PCoA分析,即主坐标分析(principal co-ordinates analysis),是一种非约束性...[作者空间]
作者:麦茬道审稿:童蒙编辑:amethyst 随着生物信息数据的爆发式增长,存储生物信息的文件格式也多样化起来,不...[作者空间]
群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图(ggplot 2) 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制...[作者空间]
1. RAxML 简介 RAxML (Random Axelerated Maximum Likelikhood)...[作者空间]
使用conda安装bowtie2遇到undefined symbol报错 直接复制报错信息进行谷歌检索,没有找到答...[作者空间]
1:在线构建RAxML树 1. CIPRES网站: CIPRES Science Gateway V3.3[htt...[作者空间]
遇到批次效应 做单细胞数据分析时,我们常常用到不同时期或不同测序平台的数据,即使是同样的细胞类型也可能不能聚类到一...[作者空间]
Conda 安装软件的时候老报错: 解决办法一: 如果不行,清除conda-forge[作者空间]
需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件...[作者空间]
新知识 关于对于生信学习的反思,最近一直接触大量的新知识,说实话,很难,因为这些新知识没有办法和我现有的知识形成联...[作者空间]
简介【注意】HUMAnN和MetaPhlAn分析前需要对下机数据进行质控。【注意】HUMAnN和MetaPhlAn...[作者空间]
文献信息: 标题:dbCAN-seq: a database of carbohydrate-active enz...[作者空间]