生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件literature search进行文献挖掘查找指定基因调控网...[作者空间]
身边的小伙伴们经常咨询我如何上传原始数据到NCBI,于是就有了这篇文章。 [图片上传中...(image-f46d...[作者空间]
今天我们介绍一款网页版序列相似性搜索工具—UCSC BLAT,这款小工具能方便快捷的告诉我们目标序列是人的还是小鼠...[作者空间]
一、对应关系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38,UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各种...[作者空间]
UCSC Xena允许用户探索基因组和/或表型变量之间相关性的功能基因组数据集。其囊括TCGA等多个数据库的数据。...[作者空间]
UCSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。拥有了本地浏览器,就可以对自己的测...[作者空间]
NCBI National Center for Biotechnology Information:美国国立生物...[作者空间]
# 下载gtf:选择的是ensembl的GRCh38.94.gtf: 下载地址:ftp://ftp.ensembl...[作者空间]
生物数据库介绍——NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Info...[作者空间]
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI ...[作者空间]
可以用来分析上游可能结合的通路,具体打开方法如下: 1.打开http://genome.ucsc.edu/ENCO...[作者空间]
对一条染色体进行测序,将测序得到的reads进行拼接,能够完全拼接起来,中间没有gap的序列称为contig。 如...[作者空间]
找到感兴趣的基因组 打开UCSC,把鼠标置于导航条的 “Genomes”; 从左边的进化树中找到感兴趣的并点击,或...[作者空间]
一、NCBI各类数据储存库 1、Sequence Read Archive (SRA):raw sequence ...[作者空间]
最早的基因组浏览器,主要是为人类基因组设计的。Kent是基因组浏览器的设计者,有兴趣可以浏览:https://us...[作者空间]
NCBI,The National(美国国家)Center for Biotechnology(生物技术) Inf...[作者空间]
文献类: PubMed :Biomedical literature citations and abstract...[作者空间]