RepeatMasker是重复序列检测的常用工具,通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列,...[作者空间]
在基因组注释上,MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别重复序列,将EST和蛋白序列比对到基因组,进行从头预测...[作者空间]
由于之前利用repeatmasker自身的lib进行屏蔽时发现,lib里没有我研究的物种,要是不指定物种的话,re...[作者空间]
背景篇 MITE属于II类非自主转座因子,并且在真核生物中存在大量的拷贝。 MITE长度大约是500bp,并且扩增...[作者空间]
GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基...[作者空间]
RepeatModeler可用来从头对基因组的重复序列家族进行建模注释,它的核心组件是RECON和RepatSco...[作者空间]
一篇对重复序列讲解相对比较完善的博文 RepeatModeler 使用RepeatModeler来通过基因组序列构...[作者空间]