Stripe是三维基因组结构中一种特殊的染色质互作模式，最早由Rao等人在2014年的研究中发现和命名。与TAD（Topologically Associating Doma...[作者空间]
写在前面 初始组装经过基因组纠错（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以将其挂载到染色体上，使其由contig/scaffold级别的基因组提升到chromoso...[作者空间]
1. repeatmodeler 2. EDTA 3. 下载homology-based库 4. repeatma...[作者空间]
deepTE的github主页 https://github.com/LiLabAtVT/DeepTE[https...[作者空间]
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-ba...[作者空间]
基因组研究发展进程 1）1.0时代：使用二代测序，组装得到的是draft genome， 特点是组装完整性比较差的...[作者空间]
kraken 是微生物组分析进行物种分类的工具，目前已经是第二代 kraken2 了。kraken2 对比 kra...[作者空间]
https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/1208274...[作者空间]
写在前面，得到HiC-pro的结果后，我们想看看显著的互作区域以及两个样本互作区域的不同. 关注正常染色体 比较不...[作者空间]
日常瞎掰 五一放假了么？ 放了！好像又没放。无所谓了，反正已经禁足快五十天了，都已经失去知觉了！有一种“不知...[作者空间]
基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （T...[作者空间]
前言 小编要分享的这篇文章是2020年10月19发表在Nature Communications杂志上，很荣幸...[作者空间]
1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后，首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量...[作者空间]
