上篇Connectivity Map(cMap)的探索应用(一)中简单提及以下两种做法:一是提供了cMAP的在线分...[作者空间]
Cancer-related Data Resources ArrayMap URL http://www....[作者空间]
今天跟大家分享的是一个在线TCGA基因表达和生存分析的工具(GEPIA2),2019年发表在NAR上,目前已更新到...[作者空间]
现在的社会正处于大数据时代,生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物,还是微生物,都有许多物种被测序。在...[作者空间]
前言 此前笔者在小张聊科研、生信人、百味科研芝士、丁香园的科研论文时间等公众号分享过一些内容,主要包括以下几个方面...[作者空间]
药物基因组学数据库介绍 1. DrugBank: https://www.drugbank.ca/ DrugBan...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 在解读传统的富集分析结果时,经常会有这样的疑问,一个富集到的通路下,既有上调差异基因,...[作者空间]
第23周 2018 — 10.21-10.27 原文链接: Application of weighted gen...[作者空间]
基因表达检测方法 基因表达需要直接或者间接测量某个生物个体内全部基因的转录产物(指狭义的转录组即mRNA)在细胞中...[作者空间]
打开方式? 可以在NCBI中打开,有geo datasets 和 geo profiles两种;也可以直接搜索ge...[作者空间]
1. GEO 数据库搜索界面 2. Find genes find gene name or symbol: 直接...[作者空间]
clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Dis...[作者空间]
从GEO数据库下载数据的方法 1、在GEO DATASETS中输入关键词,选择符合的GSE,在ftp中进行手动下载...[作者空间]
在上一篇文章《GEO数据挖掘:(一)寻找共同差异基因》中我们通过两个实验的数据寻找到了一些差异基因,本篇文章将对这...[作者空间]
在使用Bioconductor 分析芯片数据(一)中我们使用的是芯片的原始数据(即*.cel文件)进行分析,但在大...[作者空间]
今天经人提醒才发现自己对GSEA的理解完全错误,也怪自己没认真看文献和资料。重点理解: 一般的差异分析(GO和Pa...[作者空间]