参考生信技能树教程https://mp.weixin.qq.com/s/i6_x1yeMbXawfKm36ewnK...[作者空间]
学习资料来源： anndata主页：https://anndata-tutorials.readthedocs.i...[作者空间]
在用scanpy进行单细胞分析时往往要对聚类(leiden)后的簇进行细胞类型的标注并生成细胞图谱，但是在通常使用...[作者空间]
1.背景 单细胞数据分析在进行完细胞自聚类或者细胞类型注释后，一般需要对查到的差异基因可视化，用来显示基因和细胞群...[作者空间]
学习资料来源： scanpy主页：https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/...[作者空间]
有人可能会说：单细胞分析使用Seurat，monocle等R包会更加方便。但是实际分析中,测试情况是当细胞量大于5...[作者空间]
scanpy也可以使用harmony，但是其实调用的Harmonypy这个包,其实使用的话倒是比较简单，就是下面这...[作者空间]
学习资料来源：scanpy主页：https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/[...[作者空间]
对于用惯了R的人，冷不丁用下python，感觉还是不太习惯，但是python的功能做分析的速度也很有独特的优势，所...[作者空间]
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据，有时由于下游分析的需求或可视化的需求，同时由于python的运算速度的优势...[作者空间]
Scanpy数据结构：AnnData[https://www.jianshu.com/p/9b057e105c42...[作者空间]
gzh：BBio，欢迎关注 AnnData是scanpy软件使用的数据存储结构，为了更好的理解和使用scanpy单...[作者空间]
作者：童蒙编辑：angelica 代码解读scanpy又来啦，不要错过～～今天我们讲的是：高可变基因的筛选。 函数...[作者空间]
scRNAseq双细胞去除-1: DoubletFinder[https://www.jianshu.com/p/...[作者空间]
刘小泽写于2020.7.18为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐...[作者空间]
作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有...[作者空间]
一、概述 前面我们学习了pandas一些基本的知识，这一篇文章我们来学习pandas的数据处理，一些数学运算、排序...[作者空间]
第1章 准备工作第2章 Python语法基础，IPython和Jupyter第3章 Python的数据结构、函数和...[作者空间]
