DoRothEA: collection of human and mouse regulonsCollectio...[作者空间]
seurat 涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神...[作者空间]
DropSeq 简介 Drop-seq技术最初由麻省理工学院的McCarroll实验室开发，于2015年首次发表在...[作者空间]
1. 写在前面 上期介绍了刚刚更新的AnimalTFDB v4.0数据库，不仅收录的转录因子非常全面，而且同时提供...[作者空间]
古语云：天下大势，合久必分，分久必合。可见，人类在漫长的文明发展过程中总结出来：合作是提高生产效率最好的办法。而细...[作者空间]
具体改进： 使用了Seurat官网更新的最新标准化方法SCTransform v2，此方法在下游注释中可更佳清晰的...[作者空间]
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cel...[作者空间]
练习数据集的GEO编号：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Car...[作者空间]
(1). 单细胞上游软件cellranger：单细胞上游软件cellranger从头说[https://www.j...[作者空间]
近年来，空间基因表达技术得到了迅速的发展，其中最成熟的商业化平台是来自10X Genomics的Visium，它们...[作者空间]
桑基图在单细胞数据探索中的应用[https://www.jianshu.com/p/a7a6b8b11e3c]热图...[作者空间]
Immune metabolism in PD-1 blockade-based cancer immunothe...[作者空间]
这个软件就是为了绘制网络关系图，圈图等等酷炫的图片，例如这样： Cytoscape官网 一、配置环境和安装 安装J...[作者空间]
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同 现在常用的基因定量方法包括：RP...[作者空间]
TCGA转录组数据在完成差异分析后，我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息，帮助我们分析下游实验的...[作者空间]
hi，各位道友，上次我们介绍了R包DoubletFinder用于去除多细胞那么python是否也有类似的模块去除多...[作者空间]
作为一个合格的生物信息工程师，生物学的算法是必备的技能。本人从业不到一年，深感统计学知识匮乏，希望以简书作为自己的...[作者空间]
原文见https://www.statworx.com/de/blog/interactive-network-v...[作者空间]
