单细胞测序数据也可以做gsea，步骤跟用RNAseq的数据差不多，主要是要用到差异基因并且根据Fold chang...[作者空间]
10x 单细胞产生的BAM文件可以根据所需的barcode进行过滤。首先，将所需的cell barcode条形码放...[作者空间]
前言 今天想跟大家分享一下单细胞分析中的一个需求，就是如何将h5的表达量文件转化为常见的表达矩阵。大部分情况下...[作者空间]
应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍，当下应用最火热的是10X Genomics公司的Chromium解决方案...[作者空间]
Ideas 干湿结合的生物学 表观测序 可观测值是每个基因的表达量，隐变量是不同细胞类型的组成，比如建立某一类细胞...[作者空间]
用幕布写的一些单细胞、表观遗传paper的提纲和总结思考，可以配合原文文献来看，最后会附一些我觉得不错的参考文献 ...[作者空间]
Construction of a human cell landscape at single-cell lev...[作者空间]
Cell Ranger ATAC简介 cellranger-atac软件是用于处理10x Genomics平台Ch...[作者空间]
CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small sampl...[作者空间]
受2020疫情影响，我们大三的科研训练从原来的做实验变成了读paper写综述。我的科研训练主题是表观测序技术的发展...[作者空间]
在发育过程中，细胞对内外环境的刺激发生反应，从一种状态转变成另外一种状态。比如说精卵结合形成受精卵，随着不同基因的...[作者空间]
Seurat is an R package designed for QC, analysis, and exp...[作者空间]
这一篇是我的学习笔记，先附上学习链接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERH...[作者空间]
作者：ahworld链接：生信工程师的自我修养来源：微信公众号-seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请...[作者空间]
作者：ahworld链接：一文了解单细胞基因调控网络（GRN）来源：微信公众号著作权归作者所有，任何形式的转载都请...[作者空间]
