适用背景 在单细胞分析中,必要的一步是对每个细胞进行注释,这相当于给每个细胞打个标签,或者说起个别名,这些信息都存...[作者空间]
hello,周四了,这是第399篇文章,不知不觉中,已经写了很多了,但是前进的脚步是不能停止的,感觉自己要进入下一...[作者空间]
hello,大家好,这一篇我们来看一下张泽民新发表的文章,Temporal single-cell tracing...[作者空间]
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,...[作者空间]
今天领导非让写微信稿,其实我是不太想写的,但是呢,官大一级压死人,所以写的微信稿原版分享给大家,原版是不会有广告什...[作者空间]
上一期,跟大家简单介绍了下单细胞ATAC的背景知识点及其10x ATAC基础数据的获取方式[http://mp.w...[作者空间]
作者:Jenny审稿:童蒙编辑:angelica 近几年来,单细胞测序技术一直是讨论热度极其高的话题,除了单细胞转...[作者空间]
在数据分析过程中,常常需要把组间的显著性添加到图形中,但是在ggplot2中实现起来略显麻烦,幸运的是,有很多R包...[作者空间]
Overview 由于在单细胞数据(如RNA-seq、ATAC-seq)中观察到的稀疏性,细胞特征(如基因、峰)的...[作者空间]
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不...[作者空间]
要实现单细胞mRNA测序,需要解决2个难题:1. 一个人类细胞中,RNA总量大约只有10pg左右(1pg=10-1...[作者空间]
其实我平时很少分享代码,因为我觉得代码其实都是抄别人的,没什么意思,理解最重要,但是现实的情况是,大家需要代码作为...[作者空间]
大家好,新的一年开始了,我们又要投入到紧张的工作中去了,作为一名10X空间和10X单细胞分析的生信人员,也要开始新...[作者空间]
Single-Cell Characterization of Malignant Phenotypes and ...[作者空间]
作者:ahworld链接:SCENIC | 以single-cell RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能...[作者空间]
hi,各位道友,上次我们介绍了R包DoubletFinder用于去除多细胞那么python是否也有类似的模块去除多...[作者空间]
写在前面 Doublets :一个液滴或一个微孔中包含了2个或多个细胞。 对于高通量方法,在细胞捕获效率和双重比例...[作者空间]