最近重新深入生信分析的学习,重新看一下转录组还有其他分析方法看新工具和新思路。这篇日志记录Trim Galore的Singularity镜像用法(目前没有singularit...[作者空间]
经常有人问怎么找项目练手,只能说把眼睛打开,学会搜索处处都是修炼场。 在校学生可联系有生信分析需求的老师和实验室人...[作者空间]
生信log|基因组数据注释到底是怎么回事? 在一开始做生信分析的时候,我对下游的分析其实不太了解,当时频繁接触到的...[作者空间]
在求学阶段,经常听到老师或者没有做生信的同学说生信就是跑流程的,一些大佬也有发文自嘲和解释过生信不是跑流程。我自己...[作者空间]
有使用超算或者服务器的同学应该会接触过超算投递系统,在提交生信任务时,我们需要设置好资源,比如说cpu用多少,内存...[作者空间]
以前自学机器学习的时候经常遇到一些,10几个G甚至更大的数据集,自己的电脑的存储不太够,就没有做那些数据集了。直到...[作者空间]
记录一下这段时间对生信数据处理后遇到的问题和处理的方法。问题在于数据提取之后的数据存在错误。我把自己没检查导致数据...[作者空间]
dbNSFP数据库收录了PhyloP值的数据,并且是tsv格式的,为了对一下数据库,就去官网找了相关的数据,但是看...[作者空间]
最近需要下载多个数据库,随着云产品的兴起,越来越多数据库提供了不同云厂商桶(bucket)的下载地址,要想探索在也...[作者空间]
最近在DataCamp上进修,对提高python脚本的效率有了更深的理解,并且也学会了很多方法。作为一个非科班已进...[作者空间]
从0构建非ROOT用户也可以修改的Singularity镜像-以安装Mysql-server为例-超算平台 吐槽:...[作者空间]
事实上Dockerfile仅仅是一个配置和存储了Docker建立步骤的文件,用来构建镜像用的,并不是镜像或者容器的...[作者空间]
此前参加了一些生信的开源项目,在项目的代码中知道了“装饰器”的概念,也了解到了python中一些造好的装饰器。参与...[作者空间]