今天给大家推荐一个网站，该网站为我们提供了数据可视化的多种形式。 网站的名字叫做r-graph-gallery，具...[作者空间]
pheatmap参数： mat 数组矩阵（要绘制热图的数据源，保证数据是numeric类型） color 热图的颜...[作者空间]
Kallisto下游推荐的分析软件是Sleuth，所以我们本次介绍如何使用Sleuth进行相关的分析。 RNA-s...[作者空间]
本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速...[作者空间]
superqun 原创于简书 手工目录： Q1:如何在肺癌数据库中选出k-ras突变的病人样本。 1. 使用GDC...[作者空间]
GOplot 包通过封装好的函数可视化基因功能分析结果。 #1. 安装 #2. GOplot 内置数据 ##2.1...[作者空间]
做微生物16S测序的时候，公司的报告里经常会给到两种检验Adonis和ANOSIM，听过t.test、wilico...[作者空间]
sratoolkit 是NCBI提供的用于处理来自SRA 数据库测序数据的一个工具包。 #1. sratoolki...[作者空间]
liftover 是UCSC提供的一个用于不同基因组注释版本间基因组坐标转换的工具。UCSC 提供了一个web版本...[作者空间]
基因ID转换有很多方法，对高手如饮水吃饭，对新手来说却是很难逾越的高山，我推荐两个简单迅速的方法： 一 网页工具 ...[作者空间]
deepTools 是一套基于python开发的工具，适用于有效处理分析高通量测序数据，可用于ChIP-seq, ...[作者空间]
GenVisR包是一个用于基因组可视化的包。为我们提供了多种用于展示基因组突变、基因突变等图像，包括我们熟知的基因...[作者空间]
最近因为一些需求在研究TCGA数据库。关于TCGA数据库数据下载，随便搜搜就有很多文章，方法多样，可以通过R包也可...[作者空间]
上回给大家讲述了16S测序分析流程，应各位小伙伴们的要求，本期的宏基因组测序分析来啦~ - 概述 - 宏基因组测序...[作者空间]
# findMotifsGenome.pl: 在基因组区域中寻找富集Motifs HOMER 最初设计的目的用于C...[作者空间]
在基因组调控元件分析中，HOMER 可以用于发现新的motif。HOMER 通过比较两个序列集，再使用ZOOPS ...[作者空间]
HOMER 是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。HOMER 中的工具是使用Perl 和C++编写的，适用...[作者空间]
上一期的文章中（链接）我们讲解了关于GEO数据库一些背景知识，大家也都知道了GEO是一个非常实用，非常权威的基因表...[作者空间]
前言： 一般测序下机数据会存在含N比例过大、测序质量较低的碱基数占比过高、含有duplication、序列污染等低...[作者空间]
