原文:转录组组装软件:Trinity视频参考:BroadE: Trinity - How it works和基因课...[作者空间]
写在前面 前天,在学位论文的完善中,有两个疑似ERF成员始终令我困扰。植物转录因子中有个超家族AP2,包括两个亚家...[作者空间]
刘小泽写于2020.3.19偶然看到大佬又在推荐精品资源,于是进去看了看,确实写得很走心,和你分享可以详细学习学习...[作者空间]
通过单拷贝基因构建物种树,一般有两种方法: 1,Concatenation(串联法):将比对完成的单个单拷贝基因依...[作者空间]
个人博客原文地址 基本原理 [站外图片上传中...(image-38780a-1577372733833)]原始群...[作者空间]
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的...[作者空间]
SeqKit的学习 --20191017 软件的介绍 SeqKit是一种跨平台的、极快的,全面的fasta/q处理...[作者空间]
一:下载安装 Pfam软件下载地址下载对应数据地址下载三个:Pfam-A.hmm.dat.gzPfam-A.hmm...[作者空间]
整理:大月半 责编:王采荷 构建进化树的软件很多,但是找到一款符合自己三观和符合大众审美的并不那么容易,而且需要操...[作者空间]
首先是吐槽一下:这个流程的安装是真的麻烦! 流程的帮助文档https://bitbucket.org/yaanlp...[作者空间]
NOVOPlasty 是一个perl脚本,没有依赖任何其他软件,下载好以后直接可以使用。下载链接https://g...[作者空间]
加载所需的R包 设置工作路径 提取不同类型的数据 定义一个寻找密度图峰值的函数 限定取值范围 获得峰值 使用ggp...[作者空间]
Ka(dN)代表每非同义位点的碱基替代数,而 Ks(dS)则代表每同义位点的碱基替代数, Ka/Ks的比值常用于判...[作者空间]
PGCGAP是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道,该管道包含9个模块,可以接受Illumina双端...[作者空间]
互联网就是一片充满宝藏的海洋,久而久之你总会发现一些让你眼前一亮的“珍珠”,那就是实用且有趣的新奇网站; 这些网站...[作者空间]
Davey1369852697@qq.com2019/10/9 ▼更多精彩推荐,请关注我们▼[作者空间]
当全基因组分析得到成百上千样本的变异位点vcf文件时,即可开始进行下游的一系列分析。而下游分析的首先工作,就是对得...[作者空间]
binmapr是我折腾的一个R包,它能够将NGS测序得到SNP数据基于binmap进行纠错,用于更好的遗传定位。 ...[作者空间]
背景:最近慢慢走起了小麦基因组重测序分析,进行分享。小麦基因组庞大(17G),所以其他物种的流程能出来,小麦的bu...[作者空间]
一、OrthoFinder的安装 使用之前记得查看帮助文档: 二、OrthoFinder的使用OrthoFinde...[作者空间]