第二十二计 关门捉贼 一般教程都是针对传统的bulk转录组测序的表达矩阵,其实单细胞转录组也是拿到表达矩阵,只不过...[作者空间]
作者:尧小飞审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 随着10xGenomics单细胞转录组技术的普及,现在的单细胞...[作者空间]
前情回顾:单细胞时代 || 细胞身份概念的演变[https://www.jianshu.com/p/c563131...[作者空间]
笔记首先总结概括HMM相关理论知识,再通过生信序列的R语言实操对HMM深入了解 1、MM,Markov model...[作者空间]
我们在做分析的时候,常常面临如何选择参考基因组的问题,我们以Ensembl上的参考基因组为例,我们以小鼠的参考基因...[作者空间]
scale与normalize,是我们在做前期数据处理的时候经常做的操作,但是它们经常会被混淆,现在网上的一些讨论...[作者空间]
原文链接Chapter 10 Clustering[https://osca.bioconductor.org/c...[作者空间]
genecards数据库是一个汇总了150个网络数据库的基因功能查询数据库。通过这个数据库我们不仅可以查询到一个基...[作者空间]
研究蛋白之间的相互作用网络,有助于挖掘核心的调控基因。String是一个蛋白互作网络数据库,包含蛋白直接物理作用的...[作者空间]
网络图 在传统的网络图里面,一般分为非权重网络和权重网络对于非权重网络: 非权重网络的特点是只能表示两个点之间是否...[作者空间]
HPA数据库全称The human protein atlas,即人类蛋白图谱,里面有关于蛋白研究的许多信息,如蛋...[作者空间]
SingleR包简介 SingleR是一个用于对单细胞RNA-seq测序(scRNA-seq)数据进行细胞类型自动...[作者空间]
介绍 恶性实体瘤组织不仅包括肿瘤细胞,还包括与肿瘤相关的正常上皮和基质细胞,免疫细胞和血管细胞。基质细胞被认为在肿...[作者空间]
请一定看这里:写下来只是为了记录一些自己的实践,当然如果能对你有所帮助那就更好了,欢迎大家和我交流 差异分析流程:...[作者空间]
2020年3月26日,浙江大学郭国骥团队在nature发表了人类单细胞水平的细胞景观。鉴定了60种人体组织样品涵盖...[作者空间]
什么?!按照转录组筛选的5个最明显的差异基因只有2个与qRT-PCR结果一致? 转录组测序(RNA-seq)将细胞...[作者空间]
一句话评价通过动态模型评估细胞瞬间状态的RNA速度 文章信息题目:Generalizing RNA velocit...[作者空间]
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号,现在Sanger/ Illumin...[作者空间]