英文内容搬运自:https://bioinformaticsworkbook.org/introduction/d...[作者空间]
What are variants, alleles and haplotypes? What are varia...[作者空间]
需要的数据文件:ref.fa test_1.fq test_2.fq 测序数据质控(具体方法另做总结),由原始测序...[作者空间]
GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803...[作者空间]
一、VCF格式背景 1、VCF的由来 VCF(Variant Call Format)格式是记录测序结果里相对于参...[作者空间]
GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同,更加趋于流程化。 软件安装 下载GATK 目前最新版是4.1.9...[作者空间]
终于讲完了Journal club,可以踏实下来继续学习生信知识啦~ 这篇学习笔记主要是对GATK有一个初步了解,...[作者空间]
GATK最容易出错的地方,个人认为是VQSR这一步,其他的步骤倒是好说,基本上走流程都可以走下来,VQSR这一步几...[作者空间]
前言 在前面的一系列WGS文章中,我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉,虽然许多同学觉得很有帮助,但是却缺了一个重要...[作者空间]