作者:白介素2 被吐槽的 DAVID 通路富集分析是做芯片测序后得到大量基因后的常规方式,不得不承认当下用的最多的...[作者空间]
原文<Single cell RNA-seq 10x Genomics hands-on exercise>---...[作者空间]
图一般都是静止的,R语言里面有很方便的工具让他们动起来。这个R包叫gganimate,他的作用就是让ggplot2...[作者空间]
FLASH (Fast Length Adjustment of SHort reads) 是一个快速且精确的双端...[作者空间]
刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文,当时简单做了了解,但有朋友说意犹未尽,嗯我也这么觉得...[作者空间]
存储在Gene Expression Omnibus(GEO)和Sequence Read Archive(SRA...[作者空间]
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG...[作者空间]
如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析,并不能体会到Seurat的强大,因为Seurat天生为整合而生。...[作者空间]
原文英文链接:ChIP-Seq Workflow Template作者:Daniela Cassol (danie...[作者空间]
最近接触到一个新的测序method:Repli-seq!这篇笔记就是为了学习和思考浅层思考Repli-seq ...[作者空间]
直接来看例子吧。 左对齐标准化Indel,对于多等位基因位点进行拆分(annovar注释必须的)。 根据条件进行筛...[作者空间]
目录软件概述功能介绍参数详解相关链接 软件概述 HiCPlotter是python编写的, 用于不同数据类型互作矩...[作者空间]
刘小泽写于19.5.29原始数据质控永远是好的分析结果的第一步,我们主流都是采用fastqc软件,结果会产生一个h...[作者空间]
Seurat - Guided Clustering Tutorial Seurat,一个单细胞数据分析工具箱 十...[作者空间]
HOME: a histogram based machine learning approach for eff...[作者空间]
今天给大家分享一篇lncRNA研究的文章(Long non-coding RNA SNHG15 interacts...[作者空间]
目录写在前面01-What is Hic-Pro?02-How does it work?03-How to in...[作者空间]
前言 在各个行业都是有行业标准的,这样才能统一规范而方便后面的分析,在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释...[作者空间]
一、胚系突变 SNP/INDEL(Germline SNPs + Indels)的介绍 胚系突变又叫生殖细胞突变,...[作者空间]
GOplot 包通过封装好的函数可视化基因功能分析结果。 #1. 安装 #2. GOplot 内置数据 ##2.1...[作者空间]