由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时...[作者空间]
写在前面 jcvi是福建农林大学的唐海宝老师开发的一款针对基因组处理的高效工具，学好这一个工具可以解决80%以上遇...[作者空间]
快速注释已经得到的vcf文件 所需文件 ref.fa gff3文件或者gtf vcf文件 简单流程 1.建立一文件...[作者空间]
参考：https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/10280...[作者空间]
在挂载scaffold到染色体水平，scaffold的方向以及顺利是非常重要的。在该环节，可以依靠多种图谱，但是单...[作者空间]
本文首发于“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oM...[作者空间]
前言：今天放个大招，来评测多款开源的CNV识别软件的性能。CNV，全称是拷贝数变异（copy number var...[作者空间]
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，...[作者空间]
趋同进化，是指亲缘关系较远的两个或多个类群由于长期处于相似的生活环境，受到相似的选择压力的影响从而进化出相似的功能...[作者空间]
title: GDAS009-Bioconductor中的基因组注释date: 2019-09-06 12:0:0...[作者空间]
想使用一组已经是bed bim fam，在R语言中进行操作。bed文件是一个二进制文件，看不到bim文件总共有六行...[作者空间]
Interpro数据库 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库， Int...[作者空间]
基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，...[作者空间]
基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表...[作者空间]
